Os Institutos Federais, criados no ano de 2008 estão inseridos no Sistema Federal de Educação e visam a formação dos cidadãos para atuarem ativamente no mundo do trabalho. A Forma Subsequente, uma das formas pelas quais os Cursos Técnicos de Nível Médio possibilitam a formação técnica e é destinada aos discentes que já finalizaram o Ensino Médio. O objetivo desta pesquisa foi comparar os índices de eficiência acadêmica dos cursos subsequentes, nas modalidades a distância (EaD) e Presencial, ofertados pelo Instituto Federal do Amapá (IFAP) em 2018. A abordagem deste estudo é quanti-qualitativa. Os dados quantitativos foram acessados na Plataforma Nilo Peçanha (plataformanilopecanha.org). Constatou-se que a Eficiência Acadêmica dos Cursos Técnicos Subsequentes ofertados na modalidade Presencial é maior do que a dos Cursos oferecidos na modalidade a Distância. No que se refere à EaD, por esta possuir menor Eficiência Acadêmica se comparada ao Ensino Presencial, faz-se necessário que a instituição desenvolva ações de combate e prevenção à evasão. Conclui-se, a necessidade fomentar outros estudos que investiguem as problemáticas relacionadas à evasão na Educação a Distância e que também proponham outras soluções para minimizar os índices de evasão e elevar o Índice de Eficiência Acadêmica dos Cursos Subsequentes ofertados na modalidade EaD pelo Instituto Federal do Amapá.