Faktor perkembangan pesat teknologi informasi, keragaman kebutuhan pengguna, dan pencapaian tujuan pembelajaran universitas merupakan pertimbangan umum dalam pengelolaan dan pengembangan metode pembelajaran online (eLearning). Pada umumnya, pimpinan universitas menunjuk unit-unit tertentu untuk pengelolaan dan pengembangan eLearning. Dalam menjalankan fungsinya, unit-unit pengembang eLearning sering mengalami keterbatasan dan stagnasi menghadapi ketiga faktor di atas. Bagaimana pengembangan eLearning universitas memperoleh dukungan segenap komponen universitas dan selaras dengan tujuan dan proses bisnis pembelajaran universitas merupakan tantangan demi keberlanjutan eLearning universitas. Studi ini mengolaborasi proses instruksional arsitektur bisnis Education Enterprise Architecture dengan tujuan pembelajaran Universitas Gadjah Mada. Dengan menganalisis proses bisnis eLisa Universitas Gadjah Mada dan mengembangkan konsep proses bisnis eLisa, studi menghasilkan perubahan konsep proses bisnis eLisa. Pemanfaatan item proses instruksional EEA sebesar 77,4% dalam proses bisnis eLisa mengakibatkan perubahan skenario proses pembelajaran dengan eLisa. Perubahan tersebut mendorong pelibatan lebih konkret unit internal di UGM dalam pengembangan proses pembelajaran di eLisa. Arah proses pembelajaran di eLisa yang berorientasi pada pemenuhan kebutuhan belajar mahasiswa secara mandiri dan interdispliner selaras dengan tujuan proses pembelajaran universitas.