La biomasse est une source d’energie renouvelable qui presente un fort potentiel et dont le developpement constitue l’un des objectifs prioritaires du Grenelle de l’Environnement. Parmi les projets qui se developpent aujourd’hui en France, on distingue deux logiques : d’une part des projets de grande envergure (production d’electricite, biocarburants industriels) et d’autre part des initiatives plus modestes, menees a l’echelle locale, en milieu rural. Cet article pose et illustre les fondements du Systeme Energetique Agri-Territorial (SEAT). Inspire du Systeme Productif Local et du Systeme Agro-alimentaire Localise (SYAL), le concept de SEAT a ete construit a partir de l’etude de projets territoriaux de valorisation energetique de la biomasse. Le SEAT se caracterise notamment par une dynamique d’ancrage local forte ainsi qu’un processus d’innovation organisationnelle entre acteurs heterogenes. L’illustration du concept a travers deux cas d’etudes, le projet miscanthus d’Ammerzwiller dans le Haut-Rhin (68) et le projet Bois Bocage Energie dans l’Orne (61), permet de mettre en evidence un autre resultat important : le caractere multifonctionnel des SEAT.