O presente artigo origina-se de uma tese de doutoramento que teve como objetivo investigar o conceito de ecossistema presente em teses e dissertações em Educação Ambiental (EA), explorando os seus vários sentidos e significados, presentes em seu campo de origem - a Ecologia, e em suas ressignificações a partir e para além dele. Essa pesquisa, que se insere na perspectiva das investigações na linha do estado da arte da produção de conhecimento em uma dada área, analisou teses e dissertações em EA produzidas no Brasil, no período de 1980 a 2009. A partir da caracterização dessas pesquisas, procurou-se, inicialmente, identificar os principais indicadores resultantes das análises, na tentativa de explorar significados e sentidos sobre o conceito de ecossistema. Para este artigo, em particular, temos como objetivo a discussão dos possíveis significados e sentidos que temos construído sobre aspectos da delimitação espaçotemporal de um ecossistema, e suas implicações para o ensino de ciências/biologia. Os procedimentos metodológicos estão fundamentados na perspectiva da análise dialógica do discurso e inseridos no contexto da pesquisa qualitativa em educação. Os resultados mostraram sentidos divergentes e que são compreendidos a partir de perspectivas diversas sobre conceito de ecossistema, mesmo que estes não sejam enunciados diretamente. Assim, o resultado das análises evidencia esforços de aproximação com os significados originalmente empregados na Ecologia, em um sentido de validação do conhecimento científico produzido e trazendo, de forma mais tímida, elementos políticos e sociais que envolvem as questões ambientais. A partir dos dados analisados neste artigo, destacamos os possíveis desdobramentos, dos significados e sentidos apreendidos, para o discurso de ensino de conteúdos escolares da Ecologia em interface com as questões ambientais, no ensino das Ciências da Natureza. Esses significados possibilitam pensar a tendência das pesquisas em buscar a superação de sentidos contraditórios e dicotômicos encontrados nas pesquisas em EA, tais como, aqueles relacionados à: desenvolvimento sustentável ou sustentabilidade; equilíbrio ou harmonia; ser humano, cultura ou natureza, como possíveis posicionamentos ideológicos, e que são compreendidos a partir do conceito de ecossistema, mesmo que não sejam enunciados diretamente.