Abstract
Tumor ganas atau kanker merupakan salah satu masalah utama kesehatan di dunia. Pendeteksian dini sel kanker dengan menggunakan Magnetic Resonance Imaging (MRI) memungkinkan penanganan yang lebih baik. Pemilihan senyawa kontras yang tepat dapat meningkatkan akurasi diagnosa terhadap penyakit kanker. Sel kanker banyak mengekspresikan reseptor folat α yang mampu mengikat asam folat dalam tubuh. Penambahan asam folat ke dalam senyawa pengontras Gadolinium (III)-diethylene triamine pentaacetic acid (Gd-DTPA) berguna untuk meningkatkan spesifisitas diagnostik sel kanker. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi senyawa pengontras dengan molekul target reseptor folat α dengan penambatan molekul dan simulasi dinamika molekul (MD). Struktur Gd-DTPA-folat dimodelkan dari struktur kristal Gd-DTPA dan folat. Hasil penambatan molekul dan simulasi MD menunjukkan interaksi Gd-DTPA-folat menurunkan afinitas folat terhadap reseptornya. Hasil perhitungan energi reseptor folat dengan folat dan Gd-DTPA-folat pada simulasi MD masing-masing -47,65 kkal/mol dan -43,78 kkal/mol. Modifikasi dilakukan pada struktur asam folat dengan penambahan gugus formil dan diuji kembali dengan penambatan molekul dan simulasi MD. Hasil simulasi menunjukkan bahwa modifikasi berpengaruh terhadap peningkatan afinitas folat dengan reseptor folat α melalui interaksi elektrostatik, dengan energi yang dihasilkan pada penambatan molekul dan MD masing-masing sebesar -7,04 kkal/mol dan -60,04 kkal/mol. Hasil penelitian ini diharapkan dapat bermanfaat untuk menghasilkan senyawa pengontras yang spesifik terhadap sel kanker.
Highlights
PENDAHULUAN Tumor ganas atau kanker merupakan salah satu masalah utama kesehatan masyarakat
This study aims to determine the interaction of contrast agents with the target molecule, folate receptor α, using docking molecule and molecular dynamics simulations (MD)
Synthesis and functional evaluation of chiral dendrimer–triamine-coordinated Gd complexes as highly sensitive Magnetic Resonance Imaging (MRI) contrast agents
Summary
M., Pratama, B.S.W., Baroroh, U., Ghaffar, S., Soedjanaatmadja, U.M.S. PENDAHULUAN Tumor ganas atau kanker merupakan salah satu masalah utama kesehatan masyarakat. Reseptor folat (RF) adalah suatu membran protein yang memiliki berat molekul 38-40 KDa dengan ikatan glycosyl phosphatidyl inositol (GPI) sehingga dapat menempel pada permukaan sel (Adang et al 2012). Penambatan molekul digunakan untuk memprediksi bagaimana interaksi suatu protein dengan ligannya, dalam hal ini memprediksi interaksi Gd-DTPA-folat dengan reseptor folat α. Pada penelitian ini dilakukan penambatan molekul dan simulasi MD pada GdDTPA-folat dan reseptor folat untuk mengetahui interaksi dan afinitas yang terbentuk. Modifikasi pada struktur asam folat dengan penambahan gugus formil juga dilakukan dan dievaluasi dengan penambatan molekul dan simulasi MD untuk meningkatkan afinitas terhadap receptor folat α. Sedangkan perangkat lunak yang digunakan adalah: Biovia Discovery Studio 2016, Autodock 4.2, Amber, Amber Tools 15, dan Visual Molecular Dynamicss (VMD). Ligan dan reseptor folat diubah dalam bentuk format pdbqt dan penambatan molekul dilakukan menggunakan program Autodock 4. Gd parameterisasi dilakukan dengan perhitungan mekanika kuantum menggunakan program RESP
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callSimilar Papers
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
