Цель исследования: изучить лабораторный фенотип редких мутаций Лейдена [FVL А(1961)A] и гена протромбина [FII А(20210)A] при их клинической реализации в виде тромбозов. Материалы и методы. Проведено многоцентровое проспективное наблюдательное исследование, включающее 80 носителей редких генетических форм тромбофилий: FVL А(1961)A (n = 31), FII А(20210)A (n = 10) и компаунд FII G(20210)A + FVL G(1691)A (n = 39). У всех пациентов исследована резистентность фактора Va к активированному протеину С (APC-R) по нормализованному отношению (НО) и уровень активности протромбина в плазме крови в состоянии физического здоровья и в случае эпизода тромботического события. Результаты. Определена ассоциативная связь развития тромботических событий со снижением НО при оценке APC-R как у гомозиготных носителей мутации Лейден (Ме = 0,35; 95% ДИ = 0,31–0,37 по НО), так и гетерозиготных компаундов (Ме = 0,43; 95% ДИ = 0,42–0,45 по НО). Заключение. Лабораторный мониторинг пациентов с редкими формами генетических тромбофилий позволяет выделить группу высокого тромбогенного риска, нуждающуюся в пролонгированной тромбопрофилактике. Objectives: to study the laboratory phenotype of rare Leiden mutation [FVL A(1961)A] and the prothrombin gene mutation [FII А(20210)A] implementating clinically as thrombosis. Patients / Methods. A multicenter prospective observational study included 80 carriers of rare genetic kinds of thrombophilia: FVL A(1961)A (n = 31), prothrombin FII А(20210)A (n = 10) and the compound FII G(20210)A + FVL G(1691)A (n = 39). All patients were tested for the factor Va resistance to activated protein C (APC-R), normalized ratio (NR), and the plasma prothrombin activity (%) in healthy conditions and in the case of thrombotic event. Results. An associative relation between the development of thrombotic events and a decrease in NR was determined when assessing APC-R, both in homozygous carriers of the Leiden mutation (Me = 0.35; 95% CI = 0.31–0.37 in NR) and heterozygous compounds (Me = 0.43; 95% СI = 0.42–0.45 in NR). Conclusions. Laboratory follow up for patients with rare kinds of genetic thrombophilias allows to identify a group at high thrombogenic risk requiring prolonged thromboprophylaxis.