Abstract
La résistance aux antibiotiques est devenue une préoccupation de santé publique mondiale car un grand nombre de bactéries résistantes émergent continuellement. Les animaux ont été signalés comme l’une des sources de bactéries résistantes aux antibiotiques qui peuvent être transférées aux humains. Afin d’enrichir les données sur la résistance aux antibiotiques chez les animaux au Rwanda, une étude transversale a été menée dans la province de l’Est et dans la ville de Kigali pour isoler Escherichia coli présent dans des élevages de volailles en plein air et dans des élevages commerciaux. Des échantillons de matières fécales ont été prélevés dans 294 fermes avicoles et des souches d’E. coli ont été isolées et identifiées. Au total, 241 isolats d’E. coli ont été soumis à un test de sensibilité aux antibiotiques en utilisant cinq antibiotiques (gentamicine, streptomycine, rifampicine, doxycycline et érythromycine). L’utilisation d’antibiotiques chez les volailles était faible dans les élevages de volaille en plein air (30,9 %) comparativement aux élevages de poules pondeuses et de poulets de chair (100 %). Parmi les 151 éleveurs qui ont déclaré utiliser des antibiotiques chez les volailles, près de la moitié (49,7 %) ont toujours utilisé des antibiotiques sur ordonnance vétérinaire. Sur les 241 isolats d’E. coli, 43,2 % présentaient une résistance multiple à quatre des cinq antibiotiques testés. Presque tous les isolats (98,8 %) étaient résistants à l’érythromycine, 78,8 % étaient résistants à la streptomycine, 77,6 % étaient résistants à la doxycycline, 69,3 % étaient résistants à la rifampicine et quelques-uns seulement étaient résistants à la gentamicine (3,7 %). Aucune différence significative statistiquement n’a été observée en ce qui concerne la résistance des isolats aux antibiotiques selon le type de système d’élevage. Toutefois, la résistance des isolats à la doxycycline a été significativement plus élevée dans les fermes où l’utilisation d’antibiotiques a été signalée (84 %) que dans les fermes où l’utilisation d’antibiotiques n’a pas été signalée (70 %). La résistance aux antibiotiques d’E. coli observée montre l’existence d’une source potentielle de résistance qui peut être transférée aux bactéries pathogènes et avoir un impact sur les humains et les animaux.
Highlights
The sector of poultry production continues to grow and to be more industrialized in many parts of the world
In Rwanda, little is known on the extent of antibiotic resistant strains of E. coli in poultry farms, the risk of antibiotic resistance spreading from poultry to humans or other animals cannot be estimated. This baseline study aimed at investigating the distribution of antibiotic resistant strains of E. coli isolated from different poultry farming systems in the Eastern Province and Kigali City in Rwanda
Reasons of antibiotic use in poultry were statistically different according to the poultry farming system (p = 0.000)
Summary
The sector of poultry production continues to grow and to be more industrialized in many parts of the world. To alleviate poverty and ensure sustainable food security, the efficient use of the available land through poultry and small livestock production could be one of the options (Mbuza et al, 2016) In this regard, one of the options for emphasis by the government of Rwanda was to promulgate a policy that promotes the increase in animal protein production by encouraging pig, poultry and other small animal productions (MINAGRI, 2012). The poultry industry has been developing quickly in the country, mainly in the Eastern Province with a rise in commercial poultry farms in Kigali City This may imply a widespread use of antibiotics in poultry productions to control and prevent bacterial diseases but Antibiotic resistant Escherichia coli in poultry in Rwanda to promote growth in poultry (Manishimwe et al, 2015). Since the use of antibiotics in animals is poorly regulated in Rwanda (Ndayisenga, 2009) and poultry farmers lack trainings on animal health management (Mbuza et al, 2016; Mbuza et al, 2017), antibiotic resistance could emerge from poultry farms
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