한우 산유량에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop영역의 염기서열 변이효과

Abstract

본 연구는 한우의 mtDNA D-loop 영역 염기 변이가 산유량에 미치는 효과를 검증하기 위하여 수행하였다. 젖소의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환이 20 개의 지역에서 확인되었다. 그중 8, 169, 16042, 16051, 16057, 16093, 16119, 16122, 16209, 16255, 16302 bp 지역에서 높은 빈도의 염기치환이 검출되었다. 16119bp 지역에서는 T가 C로 치환된 빈도가 0 .138로 검출되었으며, 이 위치에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 -1.61 (p<0.1)로 나타났다. 16185bp 지역에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 3.557(p<0.05)로 나타났으며 G가 A로 치환된 빈도는 0.063로 나타났다. 본 연구에서 검출한 한우 다유계통 집단의 mtDNA내 D- loop 영역의 염기서열 변이 빈도와 유량과의 연관성분석 결과 등은 한우 집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석으로 다양한 유전적 지표인자 발굴에 도움 될 것이며 이를 통해 분자유전학적 기법을 이용한 한우의 육종 전략을 확립하논데 기초 자료가 되는 것은 물론 우려나라 고유 품종인 한우의 유전자원 보존과 분자육종학적인 연구에 기초 자료로서 유용하게 활용 할 수 있을 것으로 기대된다. This study was performed to analyze the sequence variations of mtDNA D-loop and their effects on milk in Hanwoo(Korean cattle). The resulting sequences were compared with previously published sequences for other cattle breeds (GenBank JOI394). The Polymerase Chain Reaction was performed to amplify a total of 964 bp between nucleotide 15758 and 383 within D-loop region of mtDNA using specific primers. Twenty polymorphic sites by nucleotide substitution were found in mtDNA D-loop region of Hanwoo. The frequencies of positions at 8, 169, 16042, 16051, 16057, 16093, 16119, 16122, 16209, 16255 and 16302 nt with high levels of sequence polymorphism were 0.150, 0.950, 0.085, 0.138, 0.106, 0.085, 0.138, 0.212, 0.085, 0.148 and 0.180, respectively. The substitution effect at 16119(p<0.1) and 16185(p< 0.05) nt was found significant on milk production. Polymorphism of mtDNA sequence in D-Ioop region could be useful for the analysis of cytoplasmic genetic variation and associations with the other economically important traits and maternal lineage analysis in Hanwoo.