La mayoría de los estudios sobre la bioacumulación de selenio (Se) y la transferencia trófica en hábitats de agua dulce se han enfocado principalmente en lugares lóticos y lénticos en regiones seleníferas elevadas. En contraste con los reportes anteriores, nos propusimos investigar la fragmentación del Se en el agua a los niveles tróficos posteriores en lagos montañosos oligotróficos, utilizando concentraciones en agua, sedimento, perifiton, algas filamentosas, contenido estomacal y tejidos de trucha degollada (Oncorhynchus clarkii), analizados mediante Espectrometría de Masas con Plasma Acoplado Inductivamente (ICP-MS por sus siglas en inglés). Los valores indicadores del nivel uno (partículas en agua) de los coeficientes de partición (Kd) o factores de enriquecimiento (EF) fueron mayores a 1,641,000 (L/kg de peso seco) y menores a 14,843. Los valores de los coeficientes de partición del lago Upper Sand Creek en el Great Sand Dunes National Park and Preserve, fueron 36,529 en sedimentos, 28,000 en algas filamentosas y 1,641,000 en perifiton. En el lago Lower Sand Creek, los coeficientes de partición fueron de 14,843 en sedimentos, 17,250 en algas filamentosas y 32,415 en perifiton. Los valores en el nivel dos (partículas en invertebrados del contenido estomacal de las truchas) para la función de transferencia trófica promedio de los invertebrados del lago Upper Sand Creek fue de 1.18, del lago Lower Sand Creek de 1.31 y del lago Louise de 1.77. Los valores del indicador de nivel tres (invertebrados en tejidos de trucha) en el lago Louise, los lagos Lower y Upper Sand Creek y el lago Trappers variaron según el tipo de tejido. En los cuatro lugares de Colorado, el rango de las funciones de transferencia trófica en el hígado de la trucha fue de 2.31–5.25, óvulo-ovario de 1.30–2.64, y músculo epaxial de 0.28–1.08. Propusimos escenarios no lineales de exposición a la red alimentaria para tres lagos subalpinos. Comparamos las funciones de transferencia trófica de Colorado en las truchas con las de las truchas de río de los lugares lénticos de Se-richer en British Columbia, Canadá. Concluimos que las concentraciones históricas (50 años o menos) de los sedimentos superficiales podían utilizarse para generar coeficientes de fragmentación adecuados en lagos oligotróficos de montaña. Las concentraciones de selenio en el contenido del estómago parecieron ser representativas de una variedad de invertebrados transmitidos por la dieta de la trucha.