Contexto: La malaria sigue siendo un grave problema sanitario mundial debido al desarrollo de resistencia a los fármacos. Es necesario encontrar nuevos fármacos con mecanismos renovables que sean eficaces para matar a los parásitos. Nuestra investigación anterior ha analizado más de un compuesto del grupo ionóforo poliéter en el extracto de acetato de etilo de Streptomyces hygroscopicus subsp. hygroscopicus. Se sabe que el poliéter ionóforo tiene un mecanismo de acción similar al de la cloroquina, que es potente inhibidor de gutatión S-transferasa de Plasmodiun falciparum (PfGST). Objetivos: Evaluar el efecto potencial del poliéter ionóforo hacia la PfGST como proteína diana a través del acoplamiento molecular. Métodos: PfGST se obtuvo del Banco de Datos de Proteínas. Los ligandos de prueba (poliéter ionóforo) y los ligandos de control (cloroquina) se obtuvieron de PubChem. El análisis farmacocinético se realizó con SwissADME, el acoplamiento molecular con PyRx 0.9, la visualización con LigPlot y PyMOL, y la dinámica molecular con YASARA para la mejor actividad del ligando. Resultados: La lenoremycina tuvo la mayor afinidad de unión a PfGST (-8,53 kcal/mol) entre otros poliéteres ionóforos, y la nigericina tuvo la mejor unión de residuos con hidrófobos e hidrógenos con una afinidad de unión de -8,25 kcal/mol en comparación con el complejo de cloroquina en el acoplamiento molecular y la simulación dinámica molecular. Conclusiones: El ionóforo poliéter podría servir como agente antimalárico mejor que la cloroquina, siendo la nigericina el mejor candidato para inhibir el PfGST en comparación con otros ionóforos poliéter.