Jeju Native Pig Research Articles

제주지역 재래흑돼지 모돈에서 발생한 소금중독증

A 3-year-old Jeju native black sow with sudden death was requested to the Jeju Self-Governing Provincial Veterinary Research Institute for diagnosis in July 2009. Because the pig died suddenly, we could not find any clinical signs. Gross lesions such as pulmonary edema, redness of heart, liver, kidney and lymph nodes were observed at necropsy. Histopathologically, there were severe eosinophilic meningoencephalitis, atrophy, degeneration and necrosis of laminar neurons, and neovascularization in cerebral cortex. Based on histopathological findings and history taking about temporal suspension of water supply, this case was diagnosed as salt poisoning of a Jeju native sow. In our best knowledge, this is the first report for salt poisoning of sow in Korea, especially in Jeju native pig.

Characterization of the European type of maternal lineage evident in extant Jeju native pigs

Using a partial D-loop sequence of mtDNA, an intensive analysis was conducted of the maternal lineages of Jeju native pigs (JNPs) from Korea. In total, 100 mtDNA sequences were obtained from Asian wild boars (AWBs), European wild boars (EWBs), Asian domestic pigs (ADPs), European domestic pigs (EDPs), and JNPs and were used for phylogeny and network analyses. Two distinct JNP groups — one (JNPA) in the Asian cluster and the other (JNPE) in the European cluster — were identified in the estimated phylogenetic tree and network. The maternal lineage of JNPE was the closest to that of EWB and a clear haplogroup was identified that shared an identical haplotype (hap04) among 15 individuals of JNPE and 2 individuals of EWB. A Landrace and an EWB shared hap03 with a JNPE. EWB, Landrace, Large White, and Duroc formed two clear haplogroups with JNPE in a parsimonious median-joining network analysis, suggesting that an obvious maternal contribution of EDP has occurred in JNPE in recent years. A pair-wise mismatch analysis also indicated that JNPE may have experienced a sudden population expansion, suggesting a more recent establishment compared with the gradual population expansion of JNPA. The JNPE group therefore should be further evaluated in order to decide whether this group should be culled or accepted into further programs for maintenance of the JNP population as a pure breed.

미토콘드리아 DNA CYTB 유전자 서열에 대한 분자 계통과 PCR-RFLP 반수체형에 근거한 제주재래돼지의 모계 기원

제주재래돼지의 모계 혈통에 대한 보다 명확한 이해를 얻기 위해, 본 연구에서는 제주재래돼지의 미토콘드리아 DNA (mtDNA) CYTB 유전자를 분석하고 이를 타 품종들에서 얻은 결과들과 비교하였다. 제주재래돼지를 포함한 돼지 6 품종에서 PCR-RFLP 분석을 수행하였고, RFLP 양상은 돼지 품종들을 뚜렷하게 구분되는 두 가지 반수체형(mtCYTB1 and mtCYTB2)으로 분리시켰다. 제주재래돼지 CYTB 서열들은 계통수 상에서 유럽과 아시아품종 cluster에서 모두 발견되었다. 제주재래돼지 CYTB들 중에서 J2 group은 중국재래돼지품종들과 근연이면서 아시아 고유 돼지 계통들과 함께 출현하였으며, 다른 한 group인 J1에 해당하는 서열들은 유럽돼지 계통들과 함께 위치하였고, 아시아 품종들보다는 스페인의 Iberian 재래돼지들과 근연인 것으로 확인되었다. 이 결과들은 현재 제주도에서 사육되고 있는 제주재래돼지 품종의 모계 기원은 크게 아시아계 돼지와 유럽계 돼지인 것으로 추정됨을 보여준다. 따라서 본 연구결과들은 제주재래돼지 집단은 과거에 가축화된 아시아 고유 돼지품종들과 공통 선조를 공유하고, 또한 20세기에 유입된 유럽계 돼지 품종들도 현재의 집단 형성에 기여한 것임을 시사하고 있다. In an effort to gain greater understanding of the maternal lineages of the Jeju native pig (JNP), we analyzed the mitochondrial DNA (mtDNA) CYTB gene and compared it with those of other pig breeds. PCR-RFLP analysis was conducted with six pig breeds including JNP, and then the RFLP patterns allowed for the separation of the pig breeds into two distinct haplotypes (mtCYTB1 and mtCYTB2). The JNP CYTB sequences were detected in both the European and Asian breed clusters on the phylogenetic tree. The J2 group was sorted with the indigenous cluster of Asian pig lineages and was related closely to Chinese native pig breeds, but a second group, J1, was sorted with the European pig lineages and appeared to be related to Spanish Iberian native pigs, rather than to Asian breeds. These results indicate that the JNP currently raised on Jeju Island have two major maternal origins estimated in Asian and European pigs. We concluded that the JNP that share a common lineage with indigenous Asian pigs were domesticated in the distant past, originating from pigs that were already being raised elsewhere at that time, and that the European pig breeds introduced in the twentieth century have also contributed to the formation of this pig population.

제주재래돼지의 성별 및 도체등급에 따른 도체특성 분석

본 연구는 도체등급을 판정받은 제주재래돼지 168두(거세돈 116두와 암퇘지 52두)를 공시돈으로 재래돼지의 성별, 도체 육질 등급별 및 육량등급별 도체특성을 조사하여 고급돈육 생산에 필요한 기초자료를 얻고자 실시하였다. 재래돼지의 도체특성의 평균치는 도체중이 72.94 kg, 도체율 72.46%, 등지방두께 20.98 mm, Hunter L* 값 38.14, a* 값 4.68, b* 값 6.04, pH 5.61, 육색도 3.61, 근내지방도 3.36, 육질등급 1.83, 그리고 육량등급 2.08로 조사되었다. 성별 도체특성에서 도체중은 암퇘지가 75.69 kg으로 거세돈 71.71 kg 보다 유의하게 무거웠으나(p<0.05), 도체율, 등지방두께, 그리고 육색도에서는 성별 간에 모두 유의한 차이가 없었다. pH는 암퇘지와 거세돈에서 각각 5.58과 5.62로 거세돈이 유의하게 높게 나타났다(p<0.05). 도체육질등급에서는 거세돈과 암퇘지의 평균등급은 1.95와 1.58로 거세돈이 유의하게 높은 등급을 보였다(p<0.05). 그리고 육량등급에서도 성별 간에 유의한 차이를 보였는데(p<0.05), 거세돈 1.90 등급보다 암퇘지 2.50 등급으로 암퇘지가 높게 나타났다. 도체 육질등급별 도체특성에서는 도체중은 도체등급이 높을수록 유의하게 무거운 것으로 나타났으며(p<0.05), 도체율에서도 도체육질등급이 높을수록(1과 2등급) 유의하게 높은 것으로 나타났다(p<0.05). 등 지방 두께는 등급 간에 유의한 차이를 보였는데(p<0.05), 등급이 높을수록 등지방 두께가 높았다. 육색도에서는 등급 간에 Hunter L* 값, a* 값, b* 값 모두 유의한 차이를 보이지 않았다. 근내지방도는 1등급은 4.06점과 3등급은 2.64점으로 등급이 높을수록(양호) 유의하게(p<0.05) 높은 점수를 보였다. 도체 육량등급별 도체특성에서 도체중과 도체율은 등급 간에 모두 유의한 차이를 보였는데(p<0.05), 등급이 높을수록(A 등급) 체중이 무겁고 도체율이 높은 것으로 나타났다. 등지방두께는 A 등급은 22.83 mm로 유의하게 높은(p<0.05) 반면에, D 등급은 18.63 mm로 등급이 낮을수록 등 지방두께도 얇았다. 육색도는 Hunter L* 값, a* 값, b* 값 모두 등급 간에 유의한 차이가 발견되지 않았으나, pH 값은 A 등급에서 5.53으로 하위등급보다 유의하게 높은 것으로 나타났다(p<0.05). 육색도판에 의한 육색도에서도 유의한 차이를 보였다(p<0.05). 근내지방도는 등급 간에 유의한 차이를 보였는데(p<0.05), 상위 A, B 등급에서는 4.00 이상으로 높았으나, 하위 C와 D 등급에서는 3.06 이하의 낮은 점수로 나타났다. 따라서 제주 재래종은 개량종보다 등지방두께는 양호하였으나, 육질과 관련된 특성을 더욱 더 심도있는 비교연구로 정확한 평가가 이루어져야 할 것으로 생각된다. The Jeju native pigs of 168 heads (116 barrows and 52 gilts) were examined to investigate the carcass characteristics related to gender, meat quality grades and yield grades. The averages of carcass characteristics for Jeju native pigs were 72.94 kg for carcass weight, 20.98 mm for backfat thickness, 38.14 for Hunter L*, 4.68 for a*, 6.04 for b*, 5.61 for pH, 3.61 for visual plate meat color, 3.36 for marbling scores, 1.83 for meat quality grades and 2.08 for yield grades, respectively. The carcass weight of gilts was significantly higher than that of barrows (p<0.05). There were no significant differences between barrows and gilts in carcass percent, backfat thickness, and meat color. The pH of barrows was significantly higher than that of gilts (p<0.05). The differences between gender groups were significantly noticed in carcass quality grades, and yield grades (p<0.05). The carcass weight, carcass percent, backfat thickness, and marbling scores for pigs with high grades(1 and 2 grades) were significantly higher than those for pigs with low grades (p<0.05). However, there was no significant difference among 4 carcass grades. The carcass weight, carcass percent, backfat thickness, pH, and meat color for carcass with high yield grades were significantly higher than those for carcass with low grades (p<0.05). The meat colors for Hunter L*, a* and b* were not significantly shown in carcass yield grades.

SINE indel polymorphism of AGL gene and association with growth and carcass traits in Landrace × Jeju black pig F2 population

Genetic polymorphisms in the glycogen debrancher enzyme (AGL) gene were assessed with regard to their association with growth and carcass traits in the F2 population crossbred Landrace and Jeju (Korea) Black pig. Three genotypes representing the insertion and/or deletion (indel) polymorphisms of short interspersed nuclear element were detected at frequencies of 0.278 (L/L), 0.479 (L/S), and 0.243 (S/S), respectively. The AGL S allele-containing pigs evidenced significantly heavier body weights at birth, the 3rd week, 10th week, and 20th week during developmental stages and higher average daily gains during the late period than were noted in the L/L homozygous pigs (P < 0.05), respectively. However, average daily gains during the early period were not significantly associated with genotype distribution (P > 0.05). With regard to the carcass traits, the S allele pigs (S/-) evidenced significantly heavier carcass weights and thicker backfat than was measured in L/L homozygous pigs (P < 0.05). However, body lengths, meat color, and marbling scores were all found not to be statistically significant (P > 0.05). Consequently, the faster growth rate during the late period and backfat deposition rather than intramuscular fat deposition cause differences in pig productivity according to genotypes of the AGL gene. These findings indicate that the AGL genotypes may prove to be useful genetic markers for the improvement of Jeju Black pig-related crossbreeding systems.

돈육 등심의 육색과 보수력 측정치 사이의 상관관계에 관한 연구

Sang Hun Moon*, Jin Yeon Jeong**, Gap Don Kim*, In Cheol Cho***, Jin Tae Jeon*, Seon Tea Joo* and Gu Boo Park*Division of Applied Life Science(BK21 program)*, Institute of Agriculture & Life Sciences**, Gyeongsang National University, National Institute of Animal Science, RDA***ABSTRACTThe objective of this study was to investigate the relationship between measurements of color and water-holding capacity (WHC) in pork loin. A total of 419 pork loins were sampled from crossbred(Landrace×Jeju native black pig) F2 pigs at a commercial slaughter house. Meat color measurements(CIE L*, a*, b*), chroma(C*) and hue angle(h) were measured with the Minolta Chromameter and WHC was measured by filter paper fluid, drip loss and cooking loss. Also pH, moisture content and crude fat content were measured at 24 hr postmortem. CIE L*, b* and h values had positive correlation with drip loss(r=0.52, 0.42), but CIE a* and C* values were not related to drip loss. Results showed that CIE L*, b*, and h color system was better than CIE L*, a*, b* color system to predict WHC, especially drip loss. pH was negatively correlated to drip loss(0.42) and CIE L* (0.67). Although CIE L* and pH were correlated to drip loss, the accuracy of their estimates for drip loss was 27% and 17%, respectively. Consequently, it was confirmed that meat color and WHC were not perfectly related and suggested that CIE L*, b*, and h color space should not be used independently to predict WHC of pork loin.(Key words :Meat color, Water-holding capacity, Pork loin)

제주재래흑돼지와 Landrace의 F2집단에서 ADCYP1R1, FABP3, MC4R, MYL2 유전자형이 성장형질에 미치는 효과

제주재래흑돼지와 Landrace의 상호교차교배를 통하여 생산된 F2 집단에 대해 총 4개의 유전자(ADCYAP1R1, FABP3, MC4R, MYL2)에서 5 좌위의 단일염기변이의 다형성을 조사하고, 성장형질들과 통계적 연관성을 분석하였다. 조사된 5종의 SNP 좌위에서 모두 다형성이 관찰되었으나, FABP3 g.-158T>C 염기치환에 대한 유전자형 중 T/T 동형접합자는 제주재래흑돼지에서는 발견되지 않았고, Landrace에서는 ADCYAP1R1의 intron 2 337 G/G 동형접합자가 발견되지 않았다. ADCYAP1R1 유전자형은 3주령체중, 20주령체중, FABP3 유전자의 g.-135delT에 대한 유전자형은 후기일당증체량에 고도의 유의차를 보였고(P<0.01), g.-158T>G 유전자형은 성장초기단계의 체중, 20주령체중, 후기일당증체량에 대해 고도의 유의차를 나타내었다(P<0.01). MC4R은 초기일당증체량의 차이에 의해 10주령체중의 유의차를 보였고(P<0.05), 후기일당증체량과도 고도의 유의차를 나타내었다(P<0.01). F2의 체장은 ADCYAP1R1, MC4R, MYL2 유전자형에 대한 통계적 유의차를 나타내었으나(P< 0.05), 이중 MC4R의 유전자형에 따른 체장의 차이가 가장 큰 폭으로 확인되었다. 본 연구의 결과들은 제주재래흑돼지와 관련된 다원교잡체계를 이용한 양돈산업에서 성장형질의 생산성 향상을 위한 제주재래흑돼지 종모돈의 선발이나, 제주재래흑돼지 품종 자체의 품종개량을 위한 분자육종체계 구축에서 유용한 기초자료가 될 것으로 사료된다. Genetic polymorphisms was investigated at five single nucleotide polymorphisms(SNP) sites in four porcine genes(ADCYAP1R1, FABP3, MC4R, and MYL2) and analyzed their statistical association with growth traits in F2 reciprocal-crossbred population between Landrace and Jeju native black pig(JNP). All populations, JNP, Landrace and their F2 were polymorphic for all five SNP loci tested, however, the homozygote T/T of FABP3 g.-158T>C and the homozygote G/G of ADCYAP1R1 intron 2 337A>G were not found in JNP and Landrace, respectively. The genotypes of ADCYAP1R1 were significantly associated with body weights(BW) at 3 weeks and at 20 weeks(P<0.05), respectivley, those of FABP3 g.-135delT were associated with late average daily gain(LADG) (P<0.01), and those of FABP3 g.-158T>G were associated with body weights during late growth period such as, BW20 and LADG(P<0.01). Those of MC4R were also significantly associated with BW10 suggesting by the difference of early average daily gain(EADG) (P<0.05), and with LADG(P<0.01). The body length of F2 animals was affected by the genotypes of ADCYAP1R1, MC4R, and MYL2(P<0.05), respectively. Among these, MC4R A/A homozygotes showed over 3 cm longer in body length than those of other genotypes. As the useful basic information, these results suggested that SNP markers showing statistical association with growth traits and the results help to select the sires of JNP for improving the productivity in JNP-related crossbreeding system in pig industry and also to construct the molecular breeding system for breed improvement of JNP itself.

제주재래돼지 집단서 집단특이적 mtDNA Haplotype과 유전적 다양성

미토콘드리아 ND2 유전자와 세 가지 tRNA (tRNA-M앙, tRNA-Trp, tRNA-Ala)들이 포함}는 mtDNA 절펀의 PCR-RFLP haplotyping 기법으로 제주도에서 사육하는 한국 재래돼지를 포함하는 5개 품종에 대한 유전적 다양성을 조사하였다. 몇몇 돼지 품종에서 mtDNA 상의 제한절편 길이의 다형성이 관찰되었다. HaeIll-와 Hinf1RFLP에서는 두 가지 제한절편 유형, Tsp509IRFLP에서는 네 가지 유형으로 각각 구분되었다. 발견된 제한절편 유형들을 조협하여 mtDNA haplotype으로 구분했을 때, 모두 네 가지 haplotype들이 발견되었고 집단에 따라 각기 다른빈도를 나타내였다. 하나의 동일한 haplotype mtWB가 한반도 야생멧돼지와 Large White 집단에서 관찰되었다. Duroc과 Landrace 품종들은 여러 모계 선조에서 유래되었을 것으로 추정되는 두 가지의 haplotype들을 가지고 있었다. 제주도에서 사육되고 있는 한국재래돼지 집단에서는 muD와 mtJN haplonpe들이 관찰되었는데, 이 중 mtJN은 빈도가 높고 집단 특이적이었다. 본 연구의 결과는 제주 돼지 집단의 형성에 적어도 둘 이상의 모계 선조가 참여했으며, 이후 동아시아 언근 돼지 품종들과의 인위적인 교잡아 이루어졌을 것으로 추정된다. 연구진의 예상과는 달리 한반도 야생멧돼지가 제주 재래돼지 집단의 모계 선조라는 증거는 확인되지 않았다. MtDNA haplotype과 돼지 계통간의 관계 에서의 특이성은 돼지 육종에 있어 모계 확인과 계보 구성에 매우 유용한 정보를 제공할 것으로 사료된다. Using PCR-RFLP haplotyping for the mitochondrial DNA(mtDNA) fragment containing the NADH dehydrogenase 2 gene(ND2) and three tRNA genes(tRNA-Met, tRNA-Trp and tRNA-Ala), we characterized the genetic diversity of five pig breeds including Jeju native pigs. mtDNA polymorphisms showing distinct cleavage patterns were found in the pig breeds. Two digestion patterns were detected when HaeIII- and Hinfl-RFLP, and four in the Tsp5091-RFLP analyses. Combining the three restriction enzyme digestion patterns found in five different pig breeds, four mtDNA haplotypes were observed and the haplotype frequencies were significantly different by the pig breeds. A monomorphic haplotype, mtWB, was observed in both Korean wild boars and Large White pigs. Both Duroc and Landrace pigs contained two haplotypes suggesting their multiple maternal lineages. Jeju native pig has two haplotypes(mtJN and mtJD). Of these, mtJN is identified as a Jeju native pig specific haplotype. This study suggested that more than two progenitor populations have been taken part in the domestication process of the Jeju native pig population, and/or probably subsequent crossing with other pig breeds from near east Asia. Unlike with our prediction, there was no direct evidence under molecular levels on the maternal introgression of Korean wild boar in the domestication of Jeju native pigs. In conclusion, specificity of mtDNA haplotypes related to pig breeds win be useful for identifying the maternal lineage as wen as constructing the genealogical pedigree in pigs.

돼지 Melanocortin Receptor 1(MC1R) 대립유전자 3의 신규 유전변이 탐색

본 연구는 MCIR<TEX>$^*$</TEX>3 allele의 돼지에 있어서 유전적 변이를 관찰하기 위하여 수행하였다. 일반적으로 흑모색 바탕에 백색반점이나 백색띠를 갖고 있는 돼지의 MCIR 유전자의 유전자형은 E<TEX>$^{D2}$</TEX>로 나타낸다. 우성 백색계통의 E<TEX>$^P$</TEX> 유전자형은 우성 흑모색 계통의 E<TEX>$^{D2}$</TEX> 유전자와 frameshift mutation 관계가 있다. 돼지 MCIR 전체 번역지역을 증폭하기 위하여 oligonucleotide primer률 제작하여 PCR을 수행 하였다. 그 결과 길이가 963<TEX>${\sim}$</TEX>966 base pairs인 돼지 MCIR 유전자의 전체번역지역을 포함하는 산물을 얻었다. 이들 번역부위의 염기서열 결정하고 이들을 Clusta1 W 프로그램을 이용하여 정렬한 결과 23번 코돈{nt68)에서 Hampshire와 제주 재래혹돈은 염기 시토신(cytosine)이 3 개 그리고 Birl‘shire의 경우 염기 시토신(cytosine)이 2개 결실되어 있었다. 그 외에 3개의 missense mutations과 하나의 frameshift mutation이 발견되었다. This study was conducted to investigate novel genetic variations of MCIR^*3 allele. In general, white spotting or white belt on a black backgroud in pigs is determined by the E<TEX>$^p$</TEX> allele at the MCIR/Extention locus. E<TEX>$^p$</TEX> shares a frameshift mutation with the E<TEX>$^{D2}$</TEX> allele for dominant black color. An oligonucleotide primer set was designed to amplify complete coding sequence of the porcine MCIR gene. The MCIR coding sequences obtained from five breeds those were Landrace(white). Yorkshire(white), Hampshire(belt), Berkshire(spot) and Jeju native black pigs(black), were used for this study. A multiple sequence alignment of the MCIR coding region using Clustal W was performed. The total length of the MCIR coding sequence ranged from 963 to 966 base pairs(bp) among the selected breeds. The sequence analysis of the complete coding region of MCIR was revealed that Hampshire and Jeju native black pig have 3 cytosines deletion and Birkshire has 2 cytosines deletion at codon 23(nt68) in Extention loci. Besides the finding, there were three different missense mutations and a frameshift mutation in the MCIR coding region.

랜드레이스, 대요크셔, 듀록 및 제주 흑돈의 Melanocortin 1 Receptor(MC1R) 유전자의 유전자형 분석

본 연구에서는 제주 재래흑돈의 모색에 관여하는 MC1R 유전자를 이용하여, 모색유전자 빈도를 조사함으로써, 제주 재래흑돈군 확보를 위한 선발계획 수립에 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 공시동물은 랜드레이스, 대요크셔, 듀록 각 품종별 20두와 제주흑돈 93두 등 총 153두를 공시하여 수행하였다. 품종별 MC1R 유전자형을 설정하기 위하여 genbank에 등록되어 있는 돼지 MC1R 유전자(AF181964)를 참고로 하여 두 쌍의 primer (MERL1-EPIG2, EPIG1-EPIG3)를 제작 PCR 증폭을 수행하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 428bp의 PCR 산물을 얻었으며, primer EPIG1-EPIG3를 이용하여 405bp의 PCR산물을 얻었다. 이들 증폭된 PCR 산물은 서로 다른 2개의 제한효소를 이용하여 PCR-RFLP를 실시하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 증폭한 428bp의 PCR산물은 제한효소 BspHⅠ(TCATG|A)을 이용하여 절단하였으며, primer EPIG1-EPIG3으로 증폭한 405bp의 PCR산물은 제한효소 AccⅡ(CGC|G)를 이용하여 절단하였다. 이들 절단된 DNA 단편은 TBE buffer에서 전기영동 후 EtBr로 염색하거나 Silver stain 염색을 하여 다형현상을 관찰하였으며, 본 연구의 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 제한효소 BspHⅠ을 이용하여 PCR-RFLP을 수행한 결과 백색의 랜드레이스와 대요크셔는 전 개체 모두가 2개의 밴드(256bp, 172bp)가 확인되었으며, 듀록은 절단되지 않은 하나의 밴드(428bp)가 확인 되었다. 그러나 제주 흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 발견되었는데, 전체 93두중 밴드가 하나인 개체는(428bp)는 29두(31.2%), 밴드가 두 개인 개체는(256bp, 172bp)는 19두(20.4%), 밴드가 3개인(428bp, 256bp, 172bp) 개체는 전체의 절반 정도인 45두(48.4%)이었다. 2. AccⅡ를 이용하여 PCR-RFLP를 실시한 결과 랜드레이스와 대요크셔 종에서는 2개의 밴드(222bp, 183)가 확인 되었으며, 듀록은 한 개의 밴드(405bp)만이 관찰되었다. 그러나 제주흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 확인되었으며, 분포빈도는 BspHⅠ을 이용한 PCR- RFLP 결과와 동일하였다. 3. 이상의 결과를 MC1R 유전자형으로 분류하면 백색품종인 랜드레이스와 대요크셔 품종은 MC1R*3 allele이었으며, 적색의 듀록은 MC1R*4 allele로서 도입종의 모색유전자는 한가지 형태로 고정되어 있었다. 그러나 제주 재래흑돈에 있어서 MC1R*2 allele과 MC1R*3 allele 모두 다 나타났으며, 대부분은 이들의 헤테로 형태였다. 따라서 제주 재래흑돈의 모색고정을 위하여 종모돈 선정시 MC1R 유전자를 이용하면, 짧은 기간 내에 모색이 고정될 것으로 추정되며, 명확한 유전양상 구명을 위해서는 agouti 유전자의 추가 연구가 필요할 것으로 사료된다. This study was conducted to investigate the genotypes and frequencies of Melanocortin 1 Receptor(MC1R) genes in pigs which plays a central role in regulation of eumelanin (black/brown) and phaeomelanin(red/yellow) pigment synthesis within the mammalian melanocytes. Four different breeds of pigs(20 Landrace, 20 Yorkshire, 20 Duroc, and 93 Jeju native black pigs) were used and PCR-RFLP analysis of MC1R gene was also carried out. Two regions of MC1R genes (428bp and 405bp) were amplified using two specific primers (MERL1-EPIG2, EPIG1-EPIG3), respectively and MC1R allele were determined using 2 restriction enzymes (BspHⅠ, AccⅡ). The results of this experiment indicated that MC1R allelic type in Landrace, Large Yorkshire and Duroc were MC1R *2 (Ep), MC1R *2 (Ep), MC1R *4 (e), respectively. However, various allelic types of MC1R genes were detected in Jeju native black pigs. MC1R allelic type of Jeju black pigs was MC1R*2 type as in Meishan and Large black breeds or MC1R*3 type as in Hampshire and Berkshire breeds and the gene frequencies of ED1 and ED2 were 0.554 and 0.446 in average.