IntroductionLe financement basé sur les résultats (FBR) est une intervention à l’échelle du système de santé dont les effets sur les piliers de ce système ne sont pas souvent mesurés, surtout au niveau du système d’information et de suivi des interventions de santé.MéthodesL’étude transversale faite au Bénin dans 67 formations sanitaires tirées au hasard dans deux zones sanitaires FBR_PRPSS, deux zones FBR_PASS, toutes exposées au FBR et deux zones non exposées au FBR, a permis d’évaluer la qualité du système d’information et de suivi. L’indice de qualité et les scores de performance des composantes du système ont été utilisés pour comparer les strates exposées au FBR à la strate non exposée.RésultatsLa qualité du système d’information et de suivi est moyenne dans les trois strates, avec des indices de qualité plus élevés dans les strates FBR_PRPSS (77%) et FBR_PASS (74%) que dans la strate Non_FBR (67%). La distribution de la qualité du système au sein des strates est plus favorable aux strates exposées aux FBR. Les composantes ayant une bonne performance sont “Information démographique”, “Résultats et analyses essentiels” et “Archivage des supports statistiques”. Toutefois, des composantes importantes pour le FBR et le système d’information telles “Supervision” et “Rapportage” continuaient d’avoir un IQ moyen, deux ans après le début de l’intervention.ConclusionLa performance moyenne du système d’information et de suivi pourrait davantage s’améliorer avec le respect des directives du FBR, surtout si la qualité de ce système devient une priorité du FBR.