Introducción. El cáncer de mama triple negativo (TNBC) representa alrededor del 20 % de todos los casos de cáncer de mama a nivel mundial, siendo uno de los cánceres más agresivos, ya que se asocian con grados tumorales avanzados, así como con alteraciones en la expresión de genes implicados en la regulación de la proliferación y supervivencia celular. Las chalconas [(1,3-diaril)-2-propen-1-ona] son compuestos orgánicos valiosos para el desarrollo de fármacos, los cuales han mostrado actividad anticancerígena frente a diversas células tumorales, incluido el carcinoma mamario, debido a que modulan la expresión génica en diversos mecanismos asociados al crecimiento y proliferación celular. Objetivo. Identificar genes que pudieran estar involucrados con el efecto anticancerígeno de la chalcona fluorada, utilizando la línea celular MDA-MB-231 como modelo de esta condición. Metodología. Sintetizamos el derivado de chalcona (E)-3-(4-fluorofenil)-1-(2-pirazinil)-prop-2-en-1-ona, por el método de condensación de Claisen-Schmidt. Luego, utilizando un enfoque de secuenciación de próxima generación (NGS), comparamos los transcriptomas de las células MDA-MB-231 tratadas frente a las no tratadas, para identificar los genes involucrados en el efecto anticancerígeno de la chalcona fluorada. Resultados. Encontramos que este compuesto regula a la baja varios genes involucrados en la progresión del ciclo celular, entre ellos: ciclina A, ciclina B1 y Cdc2, además de aumentar la expresión de genes que regulan negativamente este mecanismo, incluyendo: p21 y p27. Conclusión. Esta investigación indica que la chalcona fluorada detiene la progresión del ciclo celular mediante la regulación de genes importantes implicados en este mecanismo.