La hidrologia ha utilizado metodos tradicionales para pronosticar niveles de inundacion. Sin embargo, estos pueden generar problemas de precision, causados por el comportamiento no lineal de las inundaciones y las limitaciones al no incluir todas las variables, como flujo, y nivel de agua y precipitacion. En consecuencia, algunos cientificos comenzaron a utilizar metodos no convencionales basados en modelos de inteligencia artificial, pronosticando las inundaciones de manera mas precisa y rigurosa. Este articulo presenta una comparacion de un modelo de transito de flujo unidimensional desarrollado en HEC-RAS y un modelo de inteligencia artificial, basado en redes neuronales artificiales, desarrollado en MatLab, para predecir inundaciones. El analisis de los resultados se llevo a cabo utilizando seis indicadores estadisticos: error absoluto medio (MAE, por su nombre en ingles); error cuadratico medio (MSE); error medio porcentual absoluto (MAPE, por su nombre en ingles); raiz cuadrada de la MSE; coeficiente de correlacion de Pearson (CC, por su nombre en ingles), y coeficiente de correlacion de concordancia (ρc, por su nombre en ingles). Ademas, el coeficiente de eficiencia se calculo empleando una herramienta virtual llamada Hydrotest. A partir del analisis se observo en los modelos de pronostico que el uso de redes neuronales tiene resultados precisos, dada su cercania con los datos reales: MAPE, entre 11.95 y 12.51; CC, entre 0.90 y 0.92; ρc, entre 0.84 y 0.87, y finalmente un CE mas grande que 0.8. El estudio se realizo en una seccion de las partes altas del rio Bogota, en Colombia, entre las estaciones hidrologicas de puente Florencia y Tocancipa. Los datos de flujo fueron tomados por la Corporacion Autonoma Regional de Cundinamarca (CAR) de septiembre de 2009 a octubre de 2013.