Structure par RMN d'un complexe AlcR(1-60)-ADN: Reconnaissance du petit sillon par la partie N-terminale

Abstract

Aspergillus nidulans est un champignon filamenteux capable d'utiliser l'ethanol comme source unique d'energie. La proteine AlcR est responsable de l'activation de l'expression des genes du regulon ethanol. Le domaine de liaison a l'ADN est situe dans la partie N-terminale de la proteine (a.a. 1 a 60), et sa structure determinee par RMN en solution montre un repliement global en bouquet binucleaire a zinc, avec deux helices supplementaires par rapport au motif de base. Alors que les structures deja connues de complexes ADN - bouquets binucleaires permettent de situer dans le grand sillon la quasi-totalite des interactions, nous montrons dans la presente etude l'implication du debut de la sequence dans la reconnaissance du petit sillon de l'ADN (a.a. 5 et 6).