Abstract

Simultaneous detection of watermelon mosaic virus (WMV) and zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) using duplex RT-PCR reaction

Highlights

  • IntroductionStreszczenie Wirus mozaiki arbuza (watermelon mosaic virus, Watermelon mosaic virus (WMV)) oraz wirus żółtej mozaiki cukinii (zucchini yellow mosaic virus, ZYMV) są groźnymi patogenami infekującymi uprawy roślin dyniowatych na całym świecie

  • Streszczenie Wirus mozaiki arbuza oraz wirus żółtej mozaiki cukinii są groźnymi patogenami infekującymi uprawy roślin dyniowatych na całym świecie

  • The aim of the study was to develop and optimize the duplex RT-PCR reaction for simultaneous detection of both viruses often occurring in mixed infection

Read more

Summary

Introduction

Streszczenie Wirus mozaiki arbuza (watermelon mosaic virus, WMV) oraz wirus żółtej mozaiki cukinii (zucchini yellow mosaic virus, ZYMV) są groźnymi patogenami infekującymi uprawy roślin dyniowatych na całym świecie. W Polsce występują powszechnie, szczególnie w uprawach cukinii, powodując straty w jakości i ilości plonów. Celem pracy było opracowanie i zoptymalizowanie reakcji dupleks RT-PCR do jednoczesnego wykrywania obu wirusów często stwierdzanych w infekcji mieszanej. Zaprojektowane startery amplifikowały gen kodujący białko płaszcza (CP) obu wirusów odpowiednio wielkości: 977 pz WMV oraz 415 pz ZYMV. Czułość wykrywania reakcji dupleks RT-PCR wyniosła 500 pg/μl całkowitego RNA. Specyficzność wykrywania poszczególnych produktów była sprawdzana za pomocą sekwencjonowania metodą Sangera. Opracowana technika może być wykorzystywana do rutynowego wykrywania obu wirusów w zainfekowanych próbkach. Słowa kluczowe: dupleks RT-PCR, wykrywanie, wirus mozaiki arbuza, wirus żółtej mozaiki cukinii, koinfekcja

Objectives
Conclusion
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call