Abstract

Aim. Design аис1 construction of the hepatitis E virus (HEV) genotype 3 full-size ORF3 recombimnt polypeptide. Materials and methods. Escherichia coli strains, ptasmid vectors, serologiral and biological amples, molecular biological, bioinformatic, biotechnological, biochemical and serological methods.Results. RNA was isolated from pig fecal extracts collected on Belgorod farms and was used in RT-PCR to obtain the fragment of the orf3 gene of the hepatitis E virus genotype 3. Using A/T-cloning a recombinant plasmid was obtained with insertion of a DNA fragment (230 bp) encoding the N-terminal region of the ORF3 protein. The primary structure of the missing C-terminal region of the ORF3 VGE of the genotype 3 was calculated by bioinformatics methods. Codon optimization of the sequence for biosynthesis in E.coli cells was performed. For constructing the recombinant plasmid a chemically synthesized DNA fragment encoding the fulllength ORF3 protein had been used. E.coli strain producing full-size recombinant protein ORF3 fused to E.coli beta-galactosidase was developed. Recombinant protein ORF3 had been isolated from the inclusion bodies of the E.coli biomass and purified by size exclusion chromatography. Antigenic specificity of recombinant polypeptide had been confirmed in immunochemical reactions (ELISA, Western blot) with sera from patients with hepatitis E and control groups of patients. Conclusion. HEV genotype 3 ORF3 recombinant antigen had been designed, and itfs applicability in diagnostic tests had been experimentally confirmed.

Highlights

  • Ключевые слова: вирус гепатита Е, вируса гепатита Е (ВГЕ) 3 генотипа, ген orf3, рекомбинантный антиген ORF3, иммуноферментный анализ, ИФА, Вестерн-блоттинг

  • E., Khudyakova N.S, Jue D.L. et al Comparative characterization of antigenic epitopes in the immunodominant region of the protein encoded by open reading frame 3 in Burmese and Mexican strains of hepatitis E virus

  • Ключевые слова: бронхиальная астма, хронической обструктивной болезнью легких (ХОБЛ), сочетанная форма бронхиальной астмой (БА)/ХОБЛ, респираторный микробиом

Read more

Summary

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Праймеры и пробы для проведения ПЦР и секвенирования синтезировали в ЦКП ВНИИСБ «Биотехнология». ПЦР-продукты необходимого размера выделяли из агарозных гелей после электрофоретического разделения ампликонов, для добавления к ПЦР-продукту эктра-3′-dА проводили ещё один цикл амплификации с Taq-полимеразой, полученную ДНК очищали на колонках («Евроген», Россия) и использовали в A/T-клонировании. В качестве положительного контрольного образца в иммунохимических реакциях использовали ранее полученный рекомбинантный полипептид ORF3 ВГЕ 1 генотипа [4], в качестве отрицательного — β-галактозидазу E.coli, выделенную из клеток штамма PLT90, трансформированных векторной плазмидой pEL5a без вставки вирусоспецифической ДНК. По результатам ПЦР в реальном времени содержащих РНК ВГЕ 3 генотипа, выделяли тотальную РНК, которую использовали для получения кДНК в реакциях обратной транскрипции с применением праймеров dT-18, принимая во внимание факт 3′-концевого полиаденилирования вирионной РНК ВГЕ. ПЦР-продукт, содержащий ДНК-копию фрагмента генома ВГЕ 3 генотипа, был получен при использовании следующих праймеров: 5’-ATYGCCCATGGGATCRCCA-3’ (прямой), 5’-TCCAGCCCCGGRTTGTGAWA-3’ (обратный). ПЦР-продукт был вставлен в плазмиду pEL5a по соответствующим сайтам

Анализ коротких гомологичных пептидных последовательностей между белком
Количество исследованных образцов
Full Text
Paper version not known

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call

Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.