Abstract
Chryphonectria parasitica, the casual agent of chestnut blight, is one of the most important fungal pathogens of chestnut (Castanea spp.) in Europe and Hungary. In this study we analyzed the diversity of 14 Cryphonectria parasitica strains isolated from different location of Carpathian-Basin. For the analyses we used the partial sequences of the translation elongation coding gene, tef1. Our results showed that the tef1 gene, contrary to other fungal species, is not suitable for the molecular analyses of C. parasitica. In the future, for the molecular studies of C. parasitica, we need to use other molecular markers like microsatellites.
Highlights
Chryphonectria parasitica, the casual agent of chestnut blight, is one of the most important fungal pathogens of chestnut (Castanea spp.) in Europe and Hungary
Our results showed that the tef1 gene, contrary to other fungal species, is not suitable for the molecular analyses of C. parasitica
Kulcsszavak: Cryphonectria parasitica, filogenetikai elemzés, transzlációs elongációs faktor Keywords: Cryphonectria parasitica, phylogenic analysis, translation elongation factor
Summary
Chryphonectria parasitica, the casual agent of chestnut blight, is one of the most important fungal pathogens of chestnut (Castanea spp.) in Europe and Hungary. Vizsgálatunk során a Kárpát-medencéből (Magyarországról és Ukrajnából) származó Cryphonectria parasitica izolátumok diverzitását vizsgáltuk molekuláris markerrel. A fehérjét kódoló tef1 gén minden élő szervezetben megtalálható, és az más szekvenciákkal szemben nagy előnye, hogy a gén csak egy kópiában van jelen a genomban (Baldauf és Doolittle, 1997). 1. ábra: A tef1 gén sematikus vázlata, valamint a PCR-ben használt primerek helyzete (Druzhinina és Kubicek, 2005 nyomán)
Published Version (Free)
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have