Abstract
The plant CAtion/H+ eXchangers (CAX) proteins belong to Ca2+/cation antiporter (CaCA) superfamily. By using in silico methods, the CAX encoding genes in the genome of six legume species have been identified in this work. In examined legume genomes, the CAX genes belong to a small multigenic family. The number of the CAX genes in these legume species is 17 (soybean), 6 (common bean and C. cajan), 5 (M. truncatula and C. arietinum) and 3 genes (L. japonicus), respectively. The legume CAX genes vary in genomic full-length ranging from 1,213 to 11,561 base pairs. All of the genes exhibit introns (from 4 to 11 introns). Their deduced full-length protein sequences range from 248 to 718 amino acids. Theoretical pI values of most (39/42) of legume CAX proteins were less than 7. The secondary structure modelling of protein exhibit transmembrane helix region (from 3 to 11 regions). Half of all (23/42) included 11 transmembrane helix regions. Based on phylogeny analysis, all of the legume CAX were divided into two groups, A and B, each consisting of two subgroups. The phylogeny suggested an ancient gene duplication in the genome of legumes ancestry. The recent gene duplication even was only detected in the soybean genome after the speciation. The expression analysis showed that all of 3 L. japonicus CAX genes expressed in all examined tissues. However, the expression of C. cajan CAX genes was not detected. For each of 4 remaining legumes, the CAX genes were differed in their expression level depending on studied tissues. The tissue-specific expressions of some CAX genes were observed in 5 out of the 6 legume species, except C. cajan.
Highlights
Nhiều protein CAtion/H+ eXchangers (CAX) ở thực vật giữ vai trò vận chuyển và duy trì cân bằng nội môi Ca2+, nhưng một s trong s chúng được báo cáo có liên quan đến vận chuyển và duy trì cân bằng ion kim loại khác, đặc biệt là Mn2+ [2]
The plant CAtion/H+ eXchangers (CAX) proteins belong to Ca2+/cation antiporter helix region
All of methods, the CAX encoding genes in the the legume CAX were divided into two groups, genome of six legume species have been A and B, each consisting of two subgroups
Summary
Các protein trao đổi cation (CAtion eXchangers, CAX) thuộc về siêu họ protein vận chuyển ngược chiều Ca2+/cation. Các gene mã hóa CAX trong hệ gene của sáu loài cây họ Đậu đã được xác định trong nghiên cứu này. Phân tích cây phả hệ cho thấy các CAX của cây họ Đậu được chia thành hai nhóm lớn, A và B, mỗi nhóm gồm hai phân nhóm. Hiện tượng nhân gene xảy ra trong hệ gene cây tổ tiên của các cây họ đậu. Các hiện tượng nhân gene CAX mới sau quá trình biệt hóa loài chỉ phát hiện ở cây đậu tương. Cả 3 gene CAX của cây Đậu dại biểu hiện ở tất cả các mô nghiên cứu. Sự biểu hiện của các gene CAX ở cây đậu triều không được phát hiện. Hiện tượng biểu hiện ưu thế của một số gene ở các mô chuyên biệt được quan sát ở 5 trong số 6 loài. Từ khóa: protein trao đổi cation, họ Đậu (Fabaceae), cây phả hệ, biểu hiện gene, đặc tính gene
Sign-in/Register to view highlights & summary Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callMore From: Science and Technology Development Journal - Natural Sciences
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
