Karakterisasi sekuen DNA gen mtCO-1 hama penggerek pucuk (Hypsipyla sp.) pada tanaman mahoni (Swietenia macrophylla King) di Kabupaten Minahasa dan Kota Tomohon Provinsi Sulawesi Utara

Abstract

Hypsiphyla sp. termasuk Ordo Lepidoptera, Famili Pyralidae. Serangga ini merupakan salah satu hama penting pada tanaman Mahoni (Swietenia macrophylla King.). Tujuan penelitian adalah mengetahui profil gen CO1 hama penggerek pucuk (Hypsipyla sp.) pada tanaman S. macrophylla di Kabupaten Minahasa dan Kota Tomohon, Provinsi Sulawersi Utara. Metode yang digunakan adalah metode deskriptif, yaitu ekstraksi atau purifikasi double strands DNA (dsDNA) total, amplifikasi gen CO1 dengan metode PCR, visualisasi hasil PCR dengan atomatic electrophoresis qiagen, dan sekuensing. Data hasil sekuensing, yaitu konstruksi pohon filogeni dideskripsikan menurut cluster yang menggambarkan data molekuler setiap sampel. Hasil analisis perbedaan genetik antara Hypsipyla sp. asal Minahasa Utara dan Tomohon dengan H. robusta, yaitu 3,8%–4,4%. Hypsipyla sp. asal Minahasa Utara dan Tomohon dengan H. grandella, yaitu 9,0%–9,3%. Berdasarkan hasil analisis tersebut dapat diketahui bahwa kekerabatan Hypsipyla sp. di Kabupaten Minahasa Utara dan Kota Tomohon lebih dekat kepada H. robusta daripada H. grandella. Hasil analisis cluster Hypsipyla sp. di Kabupaten Minahasa Utara dan Kota Tomohon yang dipetakan dalan konstruksi pohon filogeni menunjukkan bahwa Hypsipyla sp. di Kabupaten Mihasa Utara dan Kota Tomohon Provinsi Sulawesi Utara sudah berada atau membentuk clade terpisah dengan clade H. robusta dan H. grandella yang ada di Bank Gen.