Abstract
The analysis of gene polymorphism plays an important role in assessment of disposition to infectious diseases at the population and individual level. In this paper, the frequencies of allelic versions of apolipoprotein E and 2nd type superoxide dismutase genes and the corresponding genotypes were determined in healthy persons and chronic viral hepatitis type C patients of the Europeoid population of the Tomsk Region. For the analysis of polymorphism of these genes, we used modern genetic methods: polymerase chain reaction and polymorphism of lengths of restriction fragments. For the studied population, it was revealed that the polymorphism of apolipoprotein E and 2nd type superoxide dismutase genes correlates with the development of chronic viral hepatitis type C and with the fibrogenesis process.
Highlights
The analysis of gene polymorphism plays an important role in assessment of disposition to infectious diseases at the population and individual level
The frequencies of allelic versions of apolipoprotein E and 2nd type superoxide dismutase genes and the corresponding genotypes were determined in healthy persons and chronic viral hepatitis type C patients of the Europeoid population of the Tomsk Region
It was revealed that the polymorphism of apolipoprotein E and 2nd type superoxide dismutase genes correlates with the development of chronic viral hepatitis type C and with the fibrogenesis process
Summary
Работа основана на материалах комплексного клинико-лабораторного обследования 51 пациента с диагнозом хронического вирусного гепатита С, находящегося на стационарном лечении и диспансерном учете в отделении гастроэнтерологии Томской областной клинической больницы и клинической больницы No 81 г. Для исследования ДНК на наличие полиморфизмов в изучаемых генах использовали методику ПЦР с последующей обработкой специфическими рестриктазами и определением длин фрагментов рестрикции. Для амплификации фрагмента гена АроЕ (174 bp) использовали следующие праймеры: 5’АCA-GAA-TTC-GCC-CCG-GCC-TGG-TAC-AC-3’ (прямой) в концентрации 1,56 мкмоль и 5’-TAA-GCT-TGG-CACGGC-TGT-CCA-AGG-A-3’ (обратный) в концентрации 2,5 мкмоль. Для амплификации фрагмента гена SOD2 (338 bp), содержащего полиморфизм Ala(-9)Val, использовались следующие праймеры: 5’-CTGACC-GGG-CTG-TGC-TTT-CTC-G-3’ (прямой) в концентрации 1,98 мкмоль и 5’-CTC-CCG-CCG-CTC-AGC-CTG-GAC-C3’ (обратный) в концентрации 1,54 мкмоль. Продукты амплификации фрагмента гена АроЕ подвергали рестрикции с использованием специфической эндонуклеазы BstHH I Новосибирск) для выявления полиморфизма Ala(-9)Val. В результате рестрикции при отсутствии полиморфизма в полиморфном сайте C47T образовывались следующие фрагменты: 210, 38, 33, 24, 23 и 10 bp, при наличии полиморфизма: 233, 38, 33, 24 и 10 bp. В качестве маркера размера фрагментов ДНК использовали плазмиду pUC19, расщепленную рестриктазой MspI Обработка результатов генетических исследований осуществлялась с использованием критерия отношения шансов OR с расчетом для него 95%-го доверительного интервала (ДИ)
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callDisclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
