Abstract

Elma içkurdu (cydia pomonella) zararlısının yönetimi, meyve üretiminde ciddi kayıplara neden olan ve tarım sektörü için büyük bir sorun haline gelen bir konudur. Bu çalışmada elma içkurdu ile mücadelede in siliko yöntemiyle etkili ve doğal ilaç moleküllerin belirlenmesi hedeflenmiştir. Bu çalışma kapsamında Protein Data Bank ve Dr. Duke veri tabanlarından faydalanarak hedef protein 3rvz kristal yapısı ve insektisit özelliği olan 97 adet bitki aktif molekülleri seçilmiştir. 97 adet bitki aktif moleküllerinden en iyi sonuç veren 42 molekül ve 5 adet ticari insektisit kullanılarak bir çalışma yapılmıştır. Seçilen moleküllerin konformer taramaları, geometri optimizasyonları, yapı-aktivite ilişkisi (SAR) analizleri Spartan14.V1.14 programıyla gerçekleştirilmiştir. Moleküller kenetlenme çalışmalarında Autodock Tools 1.5.6 ve Autodock Vina programları kullanılmış, ayrıca ligand-protein etkileşimini görselleştirmek için BIOVIA Discovery Studio Visualizer programı kullanılmıştır. Elde edilen sonuçlar, bağlanma afiniteleri, lineer regresyon grafikleri ve aminoasit etkileşim haritaları kullanılarak değerlendirilmiştir. Yapılan çalışma sonucunda, iyi korelasyon sağlayan, biyopestisit olma potansiyeline sahip L-7, L-9, L-13, L-14, L-16, L-18, L-19 aday molekülleri öne çıkmaktadır. Bu moleküllerin in vivo deneysel olarak incelenmesi önerilmektedir.

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call

Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.