Abstract
<h3>ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ</h3> Мобильные генетические элементы (МГЭ) оказывают значительное влияние на структуру и функционирование генома и являются источником новых генов. В результате «молекулярного одомашнивания» гены МГЭ становятся функциональной частью генома хозяина. Суперсемейство ДНК-транспозонов <i>IS630/Tc1/mariner</i> (<i>ITm</i>) является одним из самых широко распространенных и разнообразных. К настоящему времени известно несколько генов, которые появились вследствие кооптации <i>ITm</i>-транспозонов. Данная работа была направлена на поиск генов гребневика <i>Mnemiopsis leidyi</i>, в последовательность которых были включены фрагменты <i>ITm</i>-транспозонов, с последующим анализом их уровня экспрессии. <h3>МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ</h3> В представленной работе для поиска гипотетических химерных генов был использован метод локального выравнивания (BLASTn). Анализ дифференциальной активности генов оценивали с помощью совместного использования программ Kallisto и Sleuth. <h3>РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ</h3> Не было обнаружено ни одной кДНК, которая бы соответствовала полной кодирующей последовательности транспозазы какого-либо <i>ITm</i>-транспозона <i>M. leidyi</i>. Однако был обнаружен 21 уникальный транскрипт гипотетических химерных генов, имеющих участки гомологичные <i>ITm</i>-транспозонам. Транскрипционный анализ показал, что в процессе раннего эмбрионального развития, а также в тканях гребней и эпителия взрослых животных преобладающая доля гипотетических химерных генов не экспрессируется либо экспрессируется на низком уровне. Однако в нескольких локусах фиксируется дифференциальный уровень активности в процессе регенерации. <h3>ЗАКЛЮЧЕНИЕ</h3> Дифференциальная активность отдельных гипотетических химерных генов в процессе регенерации может свидетельствовать об их возможном «одомашнивании» и вовлеченности в молекулярно-генетические процессы гребневиков.
Published Version
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a call