DETECTION, BIOLOGICAL AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF SOME VIRUSES TRANSMITTED BY EDIBLE LEGUMINOUS SEEDS

Abstract

Bu çalışma, 2017 yılında Türkiye’nin farklı illerindeki üreticilerden ve firmalardan temin edilen bakla, bezelye, mercimek ve nohut tohum örneklerinde Alfalfa mosaic alfamovirus (AMV), Bean yellow mosaic potyvirus (BpYMV), Cucumber mosaic cucumovirus (CMV) ve Pea seed-borne mosaic potyvirus (PSbMV) virüslerinin bulunma durumunun belirlenmesi ve tespit edilen virüslerin biyolojik ve moleküler karakterizasyonunun yapılması amacıyla gerçekleştirilmiştir.
 Tohum örneklerinde virüslerin saptanmasında, DAS-ELISA ve RT-PCR yöntemleri kullanılmıştır. Tespit edilen virüsler mekanik inokulasyonla test bitkilerine taşınarak biyolojik karakterizasyonu yapılmıştır. Daha sonra RT-PCR yöntemiyle çoğaltılan virüslerin CP gen bölgelerinin dizi analizleri yapılarak, MEGA programı vasıtasıyla dünya izolatlarıyla karşılaştırılmalı olarak filogenetik analizi gerçekleştirilmiştir.
 Bakla, mercimek ve nohut tohum örneklerinde virüslere rastlanırken, bezelye tohumlarında herhangi bir virüse rastlanmamıştır. Baklada PSbMV, Nohutta BYMV, CMV ve PSbMV virüsleri ülkemizde ilk kez belirlenmiştir. Biyolojik karakterizasyon çalışmalarında, AMV, BYMV, CMV ve PSbMV izolatları dünya izolatlarıyla farklılıklar ve benzerlikler göstermiştir. Ayrıca, dünya izolatlarıyla yüksek oranda nükleotit ve aminoasit benzerliği tespit edilmiştir.