Analysis of differentially expressed gene fragments in the head kidney of lipopolysaccharide-stimulated Malabar grouper (Epinephelus malabaricus)

Abstract

Se estudiaron los efectos inmunologicos y el mecanismo molecular preliminar de lipopolisacaridos (LPS) en el mero malabarico ( Epinephelus malabaricus ). El mero se inyecto intraperitonealmente dos veces (con 7 dias de diferencia) con 4 mg/kg –1 peso corporal de LPS provenientes de Escherichia coli (grupo de prueba, probadores) o solucion de tampon fosfato pH 7,2 (grupo control, conductores). Veintiocho dias despues, la actividad media de antibacterianos, lisozima y polifenol oxidasa del suero mostraron valores de probador de 0,228, 0,032 y 21,8 U/ml x min, respectivamente, mientras que los valores de controlador fueron 0,200, 0,015 y 15,5 U/ml x min. Se elaboro una libreria subtractiva de cDNA del rinon cefalico estimulado con LPS de mero malabarico utilizando hibridacion substractiva por supresion. Se seleccionaron y secuenciaron 376 clones de fragmentos de genes expresados de probadores especificos, y se obtuvieron 326 EST calificados. Despues de una busqueda con los programas BLASTn y BLASTx, 312 ESTs mostraron gran similitud para 13 fragmentos de genes (14 ESTs no se asemejaron a ninguno de los genes en el GenBank). De los 13 fragmentos, dos (15,4%) estaban relacionados con inmunodefensa (factor 2 regulador de interferon-proteina de union 2-A y complejo T de proteinas 1-theta); cinco (38,5%) estuvieron relacionados con la transcripcion o la traduccion; uno (7,7%) estuvo involucrado en el metabolismo (proteina CT054); dos (15,4%) codificarian homologoproteina de diferenciacion, leucemia mieloide y la proteina 3 que contiene el dominio parche G; y tres (23,1%) eran genes de transporte de oxigeno que codifican la cadena α de hemoglobina, la cadena β de la hemoglobina y de la cadena pesada de ferritina. Los resultados mostraron que LPS podrian mejorar significativamente la inmunidad innata y regular la expresion de genes relacionados con la inmunidad, la produccion de energia