Abstract
Carried out was the retrospective genetic analysis of cholera vibrio strains which caused the outbreaks and sporadic cases of cholera in the territory of the Russian Federation from 1993 to 2006. It was elucidated that beginning from 1993 the disease had been caused by the altered strains of V. cholerae El Tor containing ctxB gene of classical type, encoding B subunit of cholera toxin, in their CTXφ prophage genome. In addition, identified were two strains whose prophage genome contained classical type rstR gene.
Highlights
Материалы и методыВ работе были использованы 10 клинических штаммов V. cholerae О1 серогруппы, полученных из Государственной коллекции патогенных бактерий «Микроб»
Проведен ретроспективный генетический анализ штаммов холерного вибриона, вызвавших вспышки и спорадические случаи холеры на территории Российской Федерации с 1993 по 2006 год
et al Development and validation of a mismatch amplification mutation PCR assay to monitor the dissemination of an emerging variant of Vibrio cholerae O1 biotype El Tor
Summary
В работе были использованы 10 клинических штаммов V. cholerae О1 серогруппы, полученных из Государственной коллекции патогенных бактерий «Микроб». Для культивирования бактерий применяли бульон и агар LB (рН 7,2), а также бульон AKI (рН 8,4). Определение чувствительности к холерным диагностическим фагам, продукции гемолизина, чувствительности к полимиксину В и реакцию ФогесПроскауэра проводили согласно МУК 4.2.2218-07 «Лабораторная диагностика холеры». Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводили в микропробирках объемом 600 мкл на амплификаторе «PTC-150» (MJ Research, США) и iCycler IQ5 (Bio-Rad, США). В реакционную смесь объемом 15 мкл (2,5 мкл буфера 3a – 0,67 М Трис-HCl pH 8,4, 0,166 М (NH4)2SO4, 0,1 % Twin 20, 200 мкг/мл BSA, 0,02 М MgCl2; 2,5 мкл смеси 2 мМ dNTP («Сибэнзим»); 0,25 мкл 5 ед/мкл Taq-полиме разы («Бионем»); по 0,5 мкл специфических праймеров; и 8,75 мкл деионизованной воды) добавляли 10 мкл анализируемой ДНК. Последовательности праймеров, использованные в работе, представлены в табл.
Sign-in/Register to view highlights & summary 
Published Version (
Free)
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a call