Abstract
The phototrophic bacteria were isolated from water and silt of Saki lake (AR Crimea). The were brown-red coloured. This bacteria used hydrogen sulfide in anaerobic photosyntetical process and stored elemental sulfur inside the cells. According to physiological, biochemical, morphological properties, this bacteria was ascribed to Chromatiacea е family. The 16S DNA gene sequence analysis based on using Blastn program revealed that investigated consecution has 94% similarity to Thiohalocapsa halophila , Thiorhodococcus bheemlicus , Marinimicrobium koreense , Marichromatium bheemlicum , and 93% similarity to Thiorhodococcus minor , Thiorhodovibrio winogradsky of Gammaproteobacteria domein. Based on the study of morphological, physiological characteristics and 16S rRNA nucleotide gene sequences, phototrophic purple bacteria of S а-2010/А strain from water of Saki lake (AR Crimea) belong to Thiorhodococcus genus . Keywords: purple sulfur bacteria, intracellular sulfur, Chromatiacea е, Thiorhodococcus.
Highlights
Тому ці бактерії є природним біофільтром у водоймах із високим вмістом сірководню, а отже, мають важливе екологічне значення
Для встановлення приналежності досліджуваних бактерій до певного роду чи виду отриману нуклеотидну послідовність гена 16S ДНК порівнювали з уже відомими нуклеотидними послідовностями різних видів мікроорганізмів [7, 14]
Ріст пурпурових сіркобактерій штаму Sа-2009/А за внесення деяких органічних сполук як додаткових джерел карбону
Summary
Проби води і мулу відбирали за методом Столбунова–Рябова у прибережній зоні східного басейну Сакського озера глибиною 0,5 м (АР Крим, Україна), використовуючи горизонтальний пластиковий батометр ємністю 1 л [6]. Оптимальні для росту температуру, значення рН та потребу бактерій у вітаміні В12 визначали у рідкому середовищі Ван Ніля. Біомасу клітин визначали турбідиметрично на фотоколориметрі КФК-3 [5]. Кількісне визначення вмісту сульфатів проводили турбідиметрично [23]. Фіксацію і контрастування клітин проводили за методом Рейнольдса [20]. Очищення й ампліфікацію 16S ДНК проводили як описано [9]. Визначення первинної структури ампліфікованих фрагментів ДНК проводили на GATC Biotech AG (Konstanz, Germany), використовуючи такі праймери: 337F: GAC TCC TAC GGG AGG CWG CAG; 518R: GTA TTA CCG CGG CTG CTG G; 928F: TAA AAC TYA AAK GAA TTG ACG GG. Для встановлення приналежності досліджуваних бактерій до певного роду чи виду отриману нуклеотидну послідовність гена 16S ДНК порівнювали з уже відомими нуклеотидними послідовностями різних видів мікроорганізмів [7, 14]. Статистичне опрацювання результатів проводили з використанням програми OriginPro 7.0
Published Version (Free)
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have