Abstract

Goal of the study: to identify profile of mutations of tuberculous mycobacteria responsible for resistance to anti-tuberculosis drugs in HIV positive and HIV negative tuberculosis patients without prior history of treatment. Materials and methods. 165 strains of tuberculous mycobacteria from HIV positive patients and 166 strains of tuberculous mycobacteria from HIV negative patients were studied in Sverdlovsk Region (TB Dispensary, Yekaterinburg). Mutations in genes were identified using microchips of TB-BIOCHIP® and TB-BIOCHIP®-2 in compliance with the manufacturer's guidelines (OOO Biochip-IMB, Moscow). Results. It was observed that 85/165 (51.52%) strains isolated from HIV positive tuberculosis patients and 58/166 (34.94%) strains isolated from tuberculosis patients not associated with HIV possessed MDR genotype (p < 0.01). The majority of MDR strains had mutations in the 531th codon of rpoB (Ser→Leu) and 315th codon of katG (Ser→Thr) (64/85, 75.29% and 38/58, 65.52% respective the groups), resulting in the high level of resistance to rifampicin and isoniazid. Each group also had approximately equal ratio (11/165, 6.67% and 12/166, 7.23% respective the groups) of strains with genomic mutations defining the resistance to isoniazid, rifampicin and fluoruquinolones. No confident difference was found in mutation patterns of genome of tuberculous mycobacteria isolated from HIV positive and HIV negative tuberculosis patients.

Highlights

  • Goal of the study: to identify profile of m utations of tuberculous m ycobacteria responsible for resistance to anti-tuberculosis drugs in H IV positive and H IV negative tuberculosis patients w ithout prior history of treatm ent

  • Materials and methods. strains of tuberculous m ycobacteria from H IV positive p atien ts and strains of tuberculous m ycobacteria from H IV negative patients were studied in Sverdlovsk Region (TB Dispensary, Yekaterinburg)

  • M utations in genes were identified using m icrochips of TB-BIO CH IP® and TB-BIO CH IP® -2 in com pliance w ith the m anufacturer's guidelines (O O O Biochip-IM B, M oscow)

Read more

Summary

Материалы и методы

Работа проведена на штаммах МБТ, выделенных из диагностического материала (мокрота, промывные воды бронхов и др.) ранее не леченных больных тубер­ кулезом за период с декабря 2012 г. по ноябрь 2013 г., проходивших обследование и лечение в ГБУЗ СО «Противотуберкулезный диспансер», г. Работа проведена на штаммах МБТ, выделенных из диагностического материала (мокрота, промывные воды бронхов и др.) ранее не леченных больных тубер­ кулезом за период с декабря 2012 г. Исследовано 165 штаммов МБТ, выделенных от больных туберкулезом в сочетании с В И Ч -ин­ фекцией в стадии СПИДа (группа I), и штаммов М БТ от 166 больных туберкулезом с отрицатель­ ным ВИЧ-статусом (группа II). Выделение ДНК из культур МБТ проводили с ис­ пользованием набора «М-Сорб-Туб» («СИНТОЛ», Россия) согласно инструкции изготовителя. Опре­ деление мутаций в генах осуществляли на микрочи­ пах «ТБ-БИОЧИП®» и «ТБ-БИОЧИП®-2» с ана­ лизом результатов гибридизации на оборудовании «Чипдетектор-01», используя программное обеспе­ чение Imageware согласно инструкции изготовите­ ля (ООО «Биочип-ИМБ», Москва). Определены мутации в генах, ответственных за устойчивость к рифампицину (rpoB), изониазиду (katG, inhA, ahpC) и фторхинолонам (gyrA)

Результаты исследования
Единичные Рифампицин
Findings
Всего с мутациями в комплексе генов
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call