Выявление и идентификация возбудителей бактериальных болезней пшеницы и ячменя в России

Abstract

Экспорт зерна представляет собой важную статью продовольственного бизнеса в России. Импортерами российского зерна являются страны Европы, Азии, Африки и Южной Америки. Каждая страна-импортер предъявляет свои требования к фитосанитарному состоянию ввозимой продукции. Важным требованием импортеров является отсутствие в партиях зерна таких возбудителей бактериальных болезней зерновых культур, как Pectobacterium rhapontici, Rathayibacter tritici, Pseudomonas fuscovaginae, Pseudomonas syringae pvs., Acidovorax avenae subsp. avenae, Xanthomonas translucens pvs., Rathayibacter rathayi и Pseudomonas cichorii. Достоверная информация о распространении данных видов бактерий на территории Российской Федерации ограничена. Методы выявления и идентификации возбудителей бактериозов на сегодняшний день не разработаны, что повышает риск распространения фитопатогенов, способных нанести существенный экономический вред сельскому хозяйству. Цель данного исследования состояла в выявлении и идентификации возбудителей бактериальных болезней пшеницы и ячменя. Для этого нами был проведен сбор образцов растительного материала пшеницы и ячменя в Родионово-Несветайском, Мясниковском, Зерноградском, Азовском и Мартыновском районах Ростовской области. Представители различных штаммов бактерий были выделены из полученных образцов с использованием соответствующих питательных сред. Тестирование штаммов было проведено методом полимеразно-цепной реакции (ПЦР) с использованием праймеров, разработанных для участка 16S рибосомальной РНК (PSF/PSR и 8UA/519B), и праймеров SyD1/SyD2, подобранных для участка генома Pseudomonas syringae (GenBank CP047267.1), с последующим секвенированием по Сэнгеру. В результате из проб пшеницы и ячменя были выделены и идентифицированы штаммы следующих бактерий: Curtobacterium sp., Paenibacillus sp., Enterobacteriaceae, Pseudomonas azotoformans, P. poae, P. azotoformans, P. hibiscicola, P. fluorescens, Stenotrophomonas sp., P. syringae pv. syringae, P. syringae pv. atrofaciens, Bacillus sp., Erwinia sp., Pantoea sp. и Pantoea agglomerans.