Abstract
Tissue samples from 228 small mammals captured from 2013 to 2015 in four districts of Irkutsk region and in one
 district of Novosibirsk region were examined for the presence of Anaplasmataceae bacteria and Babesia parasites by
 nested PCR method with subsequent sequencing of positive samples. In Ekhirit-Bulagatskiy District of Irkutsk region,
 Babesia microti DNA was found in 10.9 % of small mammals, Anaplasma phagocytophilum DNA – in 7.3 %, and Ehrlichia
 muris DNA – in 1.8 %. Infected mammals were not found in the other three examined districts of Irkutsk region.
 In Novosibirsk region, B. microti DNA was found in 8.9 % of small rodents, A. phagocytophilum DNA – in 8.9 % of small
 mammals, and Candidatus Neoehrlichia mikurensis DNA – in 8.9 % of small mammals. The identified infection agents
 corresponded to microorganism species and genetic variants previously found in Ixodes persulcatus ticks but not in
 ticks of other species.
Highlights
Tissue samples from 228 small mammals captured from 2013 to 2015 in four districts of Irkutsk region and in one district of Novosibirsk region were examined for the presence of Anaplasmataceae bacteria and Babesia parasites by nested PCR method with subsequent sequencing of positive samples
In Ekhirit-Bulagatskiy District of Irkutsk region, Babesia microti DNA was found in 10.9 % of small mammals, Anaplasma phagocytophilum DNA – in 7.3 %, and Ehrlichia muris DNA – in 1.8 %
In Novosibirsk region, B. microti DNA was found in 8.9 % of small rodents, A. phagocytophilum DNA – in 8.9 % of small mammals, and Candidatus Neoehrlichia mikurensis DNA – in 8.9 % of small mammals
Summary
Все работы с дикими животными в природе (отлов, очёс, забор крови) проводились в соответствии с требованиями МУ 3.1.1029-01 «Отлов, учет и прогноз численности мелких млекопитающих и птиц в природных очагах инфекций» и СП 1.3.3118-13 «Безопасность работы с микроорганизмами I–II групп патогенности (опасности)». Отлов мелких млекопитающих в Иркутской области проводили в 2013–2014 гг. В Эхирит-Булагатском районе было отловлено 55 животных, относящихся к шести видам: 26 полёвок-экономок (Microtus oeconomus), 14 обыкновенных бурозубок (Sorex araneus), 2 красносерых полёвок (Myodes rufocanus), 9 узкочерепных полёвок (Microtus gregalis), 3 лесных мышовки (Sicista betulina) и 1 красная полёвка (Myodes rutilus); место сбора расположено на границе лесного и пойменноболотного биотопов, популяция клещей представлена четырьмя видами: I. persulcatus, D. silvarum, D. nuttalli и H. concinna. Места сбора представлены лугополёвым и лесокустарниковым биотопами; популяция клещей представлена тремя видами: D. nuttalli, D. silvarum и I. persulcatus с существенным преобладанием D. nuttalli. В Новосибирской области отлов мелких грызунов проводили в 2014–2015 гг. Отловленных в Иркутской области, были взяты образцы печени, а от грызунов из Новосибирской области – образцы крови, печени и селезенки. Полученные продукты ПЦР были очищены с использованием GFX Columns (Amersham Biosciences, USA), нуклеотидные последовательности были определены с использованием ABI 3500 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, USA) и проанализированы с помощью программы BLASTN (http://www.ncbi.nlm.nih. gov/BLAST)
Sign-in/Register to view highlights & summary 
Published Version (
Free)
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a call