Молекулярное разнообразие рабдомиосаркомы. Применение метода высокопроизводительного секвенирования

Abstract

Поиск новых подходов для индивидуализации терапии пациентов детского возраста с рабдомиосаркомами является актуальным направлением современных научно-практических исследований. Молекулярно-генетические особенности опухоли могут быть эффективно использованы для более точного прогнозирования клинического исхода заболевания, генетически направленной терапии, а также посттерапевтического мониторинга качества ремиссии. Не вызывает сомнений, что в основе успешного лечения и контроля агрессивности клинического течения болезни лежит детальное изучение и глубокое понимание механизмов регуляции опухолевой прогрессии, что определяет актуальность этого направления исследований. В настоящей работе представляются результаты проведенного высокопроизводительного секвенирования для образцов опухолевой ткани 21 пациента с установленным диагнозом РМС (66,6% эмбрионального подтипа РМС и 33,4% альвеолярного подтипа РМС). В ходе анализа полученных данных было обнаружено 85 мутаций (однонуклеотидных замен, инсерций, делеций) в 170 различных генах. Наиболее часто мутации были обнаружены в генах EGFR (12/85; 14,1%), NRAS (8/85; 9,4%), BRCA (7/85; 8,2%), MYC (6/85; 7%), CHEK (6/85; 7%) и NF1 (5/85; 5,8%), MYCN (4/85; 4,7%). Находкой данного исследования является обнаружение новой транслокации – NSD1/FGFR4, которая на момент анализа актуальных литературных данных не описана при РМС, но является патогенной драйверной молекулярной поломкой и имеет онкогенный потенциал у генов-партнеров при другой онкопатологии. The search for new approaches to the individualization of therapy for children with rhabdomyosarcoma is an actual direction of modern scientific and practical research. Molecular and genetic features of the tumor can be effectively used for more accurate prediction of the clinical outcome of the disease, genetically directed therapy, as well as post-therapeutic monitoring of the quality of remission. There is no doubt that the basis of successful treatment and control of the aggressiveness of the clinical course of the disease lies in a detailed study and deep understanding of the mechanisms of tumor progression regulation, which determines the relevance of this direction of research. This paper presents the results of high-throughput sequencing of tumor tissue samples from 21 patients with an established diagnosis of RMS (66.6% embryonic subtype RMS and 33.4% alveolar subtype RMS). During the analysis of the obtained data, 85 mutations (single nucleotide substitutions, insertions, deletions) were found in 170 different genes. The most frequent mutations were detected in the genes EGFR (12/85; 14.1%), NRAS (8/85; 9.4%), BRCA (7/85; 8.2%), MYC (6/85; 7 %), CHEK (6/85; 7%), and NF1 (5/85; 5.8%), MYCN (4/85; 4.7%). The finding of this study is the discovery of a new translocation – NSD1/ FGFR4, which at the time of analysis of current literature data has not been described in RMS, but is a pathogenic driving molecular breakdown and has oncogenic potential in partner genes in the second oncology.