바이오 에탄올 생산을 위한 최적 효모균주의 개량을 위해 효모 genome shuffling 법을 이용하여 에탄올내성, 내열성 및 <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase 활성을 가진 효모균주의 육종을 계획하였다. 본 연구에서는 세포 외 <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase 활성을 가진 Saccharomyces cerevisiae <TEX>$BY4742{\Delta}exg1$</TEX>/pAInu-exgA 균주와 에탄올내성 및 내열성을 가진 S. cerevisiae YKY020 균주를 효모 protoplast fusion을 통하여 융합시켰다. 세포융합에 의해 <TEX>$40^{\circ}C$</TEX>에서 내열성을 보이는 네 개의 후보 균주(No. 3, 9, 11, 12)를 선별한 다음, 7% 에탄올 농도에서의 에탄올내성 및 <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase 활성을 조사하였다. 두 모균주의 모든 표현형을 보이는 하나의 균주(No. 11)가 선별되었고, 이 균주를 BYK-F11이라고 명명하였다. BYK-F11 융합균주는 <TEX>$BY4742{\Delta}exg1$</TEX>/pAInu-exgA와 YKY020균주에 비해서 증가된 세포성장속도, 에탄올 내성, <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase 활성 및 에탄올 생산성을 보임을 알 수 있었다. 따라서 본 연구에서는 다양한 특성을 가지지만 같은 접합형을 가진 효모균주들을 protoplast fusion법을 사용하여 손쉽게 새로운 산업용 효모균주로 육종시킬 수 있다는 것을 증명하였다. To improve yeast strains for bioethanol production, yeasts with ethanol tolerance, thermotolerance, and <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase activity were bred using yeast genome shuffling. Saccharomyces cerevisiae <TEX>$BY4742{\Delta}exg1$</TEX>/pAInu-exgA, which has extracellular <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase activity, and the Aspergillus oryzae and S. cerevisiae YKY020 strains, which exhibit ethanol tolerance and thermotolerance, were fused by yeast protoplast fusion. Following cell fusion, four candidate cells (No. 3, 9, 11, and 12 strains) showing thermotolerance at <TEX>$40^{\circ}C$</TEX> were selected, and their ethanol tolerance (7% ethanol concentration) and <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase activity were subsequently analyzed. All the phenotypes of the two parent cells were simultaneously expressed in one (No. 11) of the four candidate cells, and this strain was called BYK-F11. The BYK-F11 fused cell showed enhanced cell growth, ethanol tolerance, <TEX>${\beta}$</TEX>-1,3-glucanase activity, and ethanol productivity compared with the <TEX>$BY4742{\Delta}exg1$</TEX>/pAInu-exgA and YKY020 strains. The results prove that a new yeast strain with different characters and the same mating type can be easily bred by protoplast fusion of yeasts.