Em agosto de 2008, um garanhao da raca Mangalarga Marchador, de quatro anos de idade, com historico clinico de apatia, inapetencia e edema de prepucio e escroto, apresentou, ao exame clinico, exsudato purulento fluindo pelo ostio prepucial, prepucio e mucosa peniana com inumeras lesoes circulares de bordos elevados e hiperemicos, centro ulcerado recoberto por material amarelado de aspecto fibrinoso, com distribuicao multifocal. Histologicamente, a mucosa peniana apresentou areas de ulceracao associadas a infiltrado inflamatorio misto, com necrose multifocal e moderado acumulo de fibrina, que se estendiam para o tecido conjuntivo adjacente. O diagnostico morfologico foi de balanopostite ulcerativa fibrino-necrotica multifocal intensa, similar ao encontrado em casos de exantema coital equino (ECE), causado pelo herpesvirus equino 3 (EHV-3). Amostra de pele do prepucio e sangue, colhido em EDTA, foram submetidos a ensaios de PCR especificos para EHV-3, observando-se a amplificacao de um produto de tamanho esperado de 518pb. A deteccao do EHV-3 foi confirmada por meio de seu sequenciamento, sendo a sequencia de nucleotideos depositada no GenBank sob o numero GQ336877. As sequencias de nucleotideos e as de aminoacidos deduzidos apresentaram identidade de 99% e 100%, respectivamente, com a sequencia de EHV-3 disponivel no GenBank, numero AF081188. Apos 15 dias de tratamento, houve completa cicatrizacao das lesoes, com despigmentacao da pele, principalmente, no prepucio e na bolsa escrotal. Com base nos achados clinicos, histopatologicos, PCR e sequenciamento, concluiu-se tratar de um caso de exantema coital equino, sendo o primeiro com confirmacao definitiva do agente etiologico no Brasil.