Neonatal buzağı ishalleri, dünya çapında sık bildirilen, doğrudan ve dolaylı ciddi ekonomik kayıplara neden olabilen önemli morbidite ve mortalite nedenidir. Bu çalışmada, Aydın ilindeki neonatal buzağılarda ishalin etiyolojisinde rol oynayan E. coli, Cryptosporidium spp., Rotavirus, Coronavirus ve Giardia sp. etkenlerinin prevalansının belirlenmesi ve etiyolojik etkenlerin oluşturduğu klinik bulguların şiddetinin değerlendirilmesi amaçlandı. Araştırmaya, Aydın ilinde bulunan 1-28 günlük yaşta, 86 erkek ve 81 dişi olmak üzere 167 ishalli buzağı dahil edildi. Klinik muayene sonuçları temelinde buzağı sağlık skorları (BSS) belirlendi. Dışkı örneklerinde E.coli K99, Cryptosporidium spp., Rotavirus, Coronavirus ve Giardia sp. etkenlerinin belirlenmesi hızlı tanı test kiti kullanılarak gerçekleştirildi. İshale neden olan etkenlerin mono ya da koenfekte olmalarına bakılmaksızın yaygınlıkları sırasıyla Cryptosporidium spp. (%55,09), Rotavirus (%37,13), Coronavirus (%19,76), Giardia spp. (%7,19) ve E. coli K99 (%5,39) olarak tespit edildi. Koenfeksiyonlar arasında Cryptosporidium spp. + Rotavirus (%16,77) ile en yaygın kombinasyon olarak belirlendi. BSS’ye göre en yüksek skorun (6,5), Cryptosporidium + Rotavirus + Coronavirus kombinasyonunda, en düşük skorun (4) ise Cryptosporidium + Giardia kombinasyonunda olduğu saptandı. Sonuçlar, Aydın ilinde neonatal buzağılarda en yaygın ishal etkenlerinin Cryptosporidium spp. ve Rotavirus olduğunu ve BSS'yi etkileyen farklı değişkenlerin olabileceğini ortaya koymaktadır. Bu sonuçlar, buzağılarda ishalin öne çıkan etiyolojik nedenlerine yönelik etkin kontrol stratejileri geliştirmek açısından önemlidir.