Presently, only 6 out of 14 species in the frog genus Crossodactylus have had their larvae described. Regarding internal oral morphology, only C. dispar, C. gaudichaudii, and C. trachystomus have had tadpoles described. Furthermore, the osteology of C. gaudichaudii was briefly studied and constitutes the unique reference to the subject within the genus. Here, we describe the tadpole of C. aeneus, including its osteology and internal oral anatomy features, an endemic species of the Atlantic forest biome of Brazil. We also provide data from nature on their microhabitat use and abundance variation throughout the year in the streams at the study site. The external morphology of C. aeneus tadpoles is different from all of Crossodactylus spp. tadpoles described, except for C. gaudichaudii, the adult of which is also morphologically similar to C. aeneus. The osteology of C. aeneus tadpoles is similar to that of Hylodes ornatus (the single species of Hylodidae that has had its chondrocranium described) but the pair of adrostral cartilages present in the chondrocranium of H. ornatus is absent in C. aeneus and the pair of processus muscularis of H. ornatus is comparatively more developed than that of C. aeneus. The overall aspect of the oral internal morphology of C. aeneus is more similar to that of C. gaudichaudii than to other Crossodactylus species described in the literature. Our field data showed that tadpoles of C. aeneus are benthic, and that the most frequently used microhabitats were mud, sand, sand with vegetation, and mud with vegetation, all most frequently in the shallow parts of streams. At the study site in the state of Rio de Janeiro, Brazil, they were more abundant (in all stages of development) during the driest period of the year.Até o momento, apenas 6 de 14 espécies do gênero Crossodactylus tiveram suas larvas descritas. Quanto a morfologia oral interna, somente C. dispar, C. gaudichaudii, e C. tarchystomus tiveram essas características descritas. Além disso, a osteologia de C. gaudichaudii foi estudada superficialmente e é a única referência para o gênero. Neste estudo, nós descrevemos o girinos de C. aeneus, incluindo características da sua osteologia e morfologia oral interna, uma espécie endêmica da Floresta Atlântica, Brasil. Nós também apresentamos resultados sobre o uso do microhabitat e a variação na abundância dos girinos ao longo do ano em riachos da área de estudo. A morfologia oral externa dos girinos de C. aeneus difere das demais espécies do mesmo gênero, exceto de C. gaudichaudii, cujo adulto também é morfologicamente similar a C. aeneus. A osteologia dos girinos de C. aeneus é similar a de Hylodes ornatus (a única espécie de Hylodes que possui o condrocrânio descrito), porém o par de processus muscularis de H. ornatus é comparativamente mais desenvolvido do que de C. aeneus. O aspecto geral da morfologia oral interna de C. aeneus é mais similar a de C. gaudichaudii do que outras espécies do gênero. Nossos resultados de campo mostram que os girinos de C. aeneus são bentônicos e que utilizam mais frequentemente como microhabitats lodo, areia, areia com vegetação e lodo com vegetação, todos predominantemente nas partes mais rasas dos riachos. Ainda, os girinos foram mais abundantes (em todos os estágios de desenvolvimento, durante o período mais seco do ano.