La evaluación y el monitoreo de la integridad ecológica de los ecosistemas terrestres y acuáticos es un componente vital en el manejo eficaz de los recursos hídricos, planificación sostenible del uso del suelo, y el manejo y protección de la biodiversidad. Nuestro objetivo fue cuantificar, evaluar y cartografiar medidas de la condición y vulnerabilidad ecológica de las 32 sub-cuencas en Carolina del Sur. Un Análisis de Componentes Principales de 29 medidas de integridad identificó seis componentes importantes que explicaron el 78.5 por ciento de la variación en los valores de los indicadores entre cuencas hidrográficas. Estos componentes corresponden a los indicadores asociados con el desarrollo urbano y los factores de estrés humano, extensión del hábitat y la presencia de especies prioritarias, desarrollo agrícola y protección del suelo, uso del suelo ribereño y el deterioro del cauce, y la conversión y el abandono agrícola. Las medidas compuestas sobre la integridad de cuencas hidrográficas proporcionaron un medio sencillo para priorizar las cuencas hidrográficas para potenciales actividades de manejo. El enfoque utilizado en este estudio, en última instancia, proporciona un medio flexible para evaluar los patrones a gran escala de la integridad biótica que se pueden adaptar para poner de relieve las necesidades específicas en el manejo, o metas, mientras que se facilita la selección de un conjunto de medidas complementarias que efectivamente caractericen las propiedades del sistema.