Variabilidade do gene da proteína capsidial de três espécies virais que infectam videiras no Brasil

Abstract

O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade de tres virus (Rupestris stem pitting-associated virus - RSPaV, Grapevine leafroll-associated virus 2 - GLRaV-2 e Grapevine fanleaf virus - GFLV) que infectam videiras no Brasil, atraves da caracterizacao molecular do gene da proteina capsidial (CP). Foram amplificados fragmentos que compreendem os genes completos da CP de nove isolados de RSPaV (780 pb), seis de GLRaV-2 (597 pb) e tres de GFLV (1515 pb) por RT-PCR, utilizando-se oligonucleotideos especificos para cada especie viral. Os DNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Os isolados de RSPaV foram reunidos em quatro grupos pela analise filogenetica das sequencias obtidas com valores de identidade de nucleotideos (nt) que variaram de 81 a 99%. Para GLRaV-2, dois grupos foram definidos a partir das sequencias de nt, com valores de identidade que variaram de 88 a 99% e, para GFLV, foram definidos dois grupos, com valores de identidade de nt que variaram de 89 a 98%. Os diferentes isolados das tres especies virais estudadas tambem foram detectados utilizando-se hibridizacao com sondas nao-radioativas, marcadas com digoxigenina, possibilitando identificar de forma inequivoca as amostras infectadas, independentemente dos isolados virais empregados para sintese das sondas.