Use of a monoclonal antibody and genomic fingerprinting by repetitive-sequence-based polymerase chain reaction to identify Xanthomonas populi pathovars

Abstract

Diagnostic tools to facilitate the rapid and specific identification of Xanthomonas populi pv. populi, the cause of bacterial canker of poplar, were evaluated. A monoclonal antibody, MAb 13E7, that reacted in immunofluorescence tests with representative strains of physiological races of X. populi pv. populi as well as with the related X. populi pv. salicis and showed less cross-reaction with other xanthomonads than did a polyclonal antibody, was produced. The Xanthomonas strains were also characterized by rep-PCR (repetitive-sequence-based polymerase chain reaction) genomic fingerprinting, using three DNA primer sets (BOX, ERIC, and REP). Computer-assisted phylogenetic analysis of the linearly combined fingerprints clearly distinguished the strains of X. populi pv. populi. Fingerprint clusters of the two X. populi pathovars had ~60% similarity while the X. populi group had <20% similarity to the other xanthomonads. Des outils diagnostiques visant à faciliter l'identification rapide et spécifique du Xanthomonas populi pv. populi, agent causal du chancre bactérien du peuplier, ont été évalués. L'anticorps monoclonal MAb 13E7 qui a été produit a réagi, au cours des épreuves d'immunofluorescence, avec des souches représentatives des races physiologiques du X. populi pv. populi ainsi qu'avec le pathovar apparenté X. populi pv. salicis. De plus, il a montré une réaction croisée moins intensive qu'un anticorps polyclonal avec les autres xanthomonades. Les souches de Xanthomonas ont également été caractérisées par empreinte génomique par réaction en chaîne de la polymérase basée sur une séquence répétitive à l'aide de trois ensemble d'amorces d'ADN (BOX, ERIC et REP). L'analyse phylogénique assistée par ordinateur des empreintes linéairement combinées a permis de distinguer clairement les différentes souches du X. populi pv. populi. La similarité des groupes d'empreintes des deux pathovars du X. populi était d'environ 60%, tandis que celle du groupe du X. populi était de moins de 20% par rapport aux autres xanthomonades.