Abstract

Multiple sclerosis (MS) is a severe chronic CNS disease characterized by autoimmune inflammation, demyelination, and neurodegeneration. The interaction of mitochondrial and nuclear genomes is shown to be important in the formation of a predisposition to many diseases.Objective: to analyze the association of MS with the carriage of biallelic combinations, including as components the polymorphisms of three genes of mitochondrial DNA (mtDNA) and those of 16 nuclear genes, the products of which are involved in the functioning of the immune system and may participate in the development of autoimmune inflammation in MS; and, if these combinations are identified, to determine the nature of an interaction between their components. Patients and methods. The investigation enrolled 540 MS patients and 406 control group individuals; all were Russians. The mitochondrial genome was genotyped by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis. APSampler software was used for multilocus association analysis. Results and discussion. The investigators identified five biallelic combinations that were associated with MS (p=0.0036–0.022) and possessed protective properties (odds ratio (OR) 0.67–0.75). The mitochondrial component of the identified combinations was the polymorphisms m.4580 (rs28357975), m.13368 (rs3899498), and m.13708 (rs28359178) mtDNA; the nuclear component was CXCR5 (rs523604), TNFRSF1A (rs1800693), and CD86 (rs2255214) gene polymorphisms. The interaction between the components of the identified combinations was additive. Conclusion. The data obtained in the Russian population suggest that the combined contribution of the mitochondrial and nuclear genomes may affect the risk of developing MS.

Highlights

  • Multiple sclerosis (MS) is a severe chronic CNS disease characterized by autoimmune inflammation, demyelination, and neurodegeneration

  • Objective: to analyze the association of MS with the carriage of biallelic combinations, including as components the polymorphisms of three genes of mitochondrial DNA and those of 16 nuclear genes, the products of which are involved in the functioning of the immune system and may participate in the development of autoimmune inflammation in MS; and, if these combinations are identified, to determine the nature of an interaction between their components

  • The mitochondrial genome was genotyped by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis

Read more

Summary

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И МЕТОДИКИ

Сочетанное влияние ядерного и митохондриального геномов на риск развития рассеянного склероза. Цель работы – анализ ассоциации РС с носительством биаллельных сочетаний, включающих в качестве компонентов полиморфизмы трех генов митохондриальной ДНК (мтДНК) и полиморфизмы 16 ядерных генов, продукты которых вовлечены в функционирование иммунной системы и могут участвовать в развитии аутоиммунного воспаления при РС; в случае выявления таких сочетаний – определение характера взаимодействия между их компонентами. Еще одним объяснением феномена «потерянной наследуемости» может быть существование нелинейных (эпистатических) взаимодействий между компонентами генома, при которых эффект носительства одного генетического варианта зависит от носительства другого/других, неаллельного/неаллельных ему [6], поскольку такие взаимодействия не выявляются при анализе ассоциации генов с заболеванием по отдельности. Единственная опубликованная работа, в которой рассматривалось влияние митохондриально-ядерных взаимодействий на риск развития РС, была проведена нашим коллективом на сравнительно небольшой выборке (283 больных РС и 290 здоровых лиц контрольной группы) и включала пять полиморфизмов мтДНК [13].

Эндонуклеаза рестрикции
Биаллельные комбинации генетических вариантов pFLINT
Findings
Каждое из найденных сочетаний характеризовалось
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call