Abstract

O objetivo deste trabalho foi avaliar o tamanho ótimo de populações de irmãos completos, para estudos de mapas de marcadores moleculares, por meio de simulações de genomas e tamanhos de populações. Foram simulados genomas parentais e amostras de populações de família de irmãos completos do tipo completamente informativas, e também não completamente informativas. As amostras geradas foram de 100, 200, 400 e 600 indivíduos, com três grupos de ligação cada, e 11 marcas moleculares codominantes e multialélicas, espaçadas a dez centimorgans por grupo de ligação. Foram realizadas 100 repetições por amostra. Para populações completamente informativas, o tamanho populacional de 200 indivíduos é suficiente para recuperar as informações originais, contudo, para a população não completamente informativa, é necessária a utilização de uma população maior, de 600 indivíduos.

Highlights

  • O mapeamento genético facilita o trabalho de melhoramento, uma vez que uma ou mais marcas do genótipo podem estar associadas a um ou mais genes controladores de características qualitativas e quantitativas (QTL)

  • O número de grupos de ligação esperado no mapeamento das duas populações era três, que era o número de grupos de ligação que se tinha no genoma original usado para a simulação das populações

  • O tamanho esperado nos grupos de ligação, após o mapeamento das populações, era de 100 cM, uma vez que esse era o tamanho de cada grupo de ligação no nível de saturação do genoma utilizado para a simulação das populações

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Summary

Tamanho de população ideal para mapeamento genético

Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos Leonardo Lopes Bhering(1) e Cosme Damião Cruz(1). Resumo – O objetivo deste trabalho foi avaliar o tamanho ótimo de populações de irmãos completos, para estudos de mapas de marcadores moleculares, por meio de simulações de genomas e tamanhos de populações. Foram simulados genomas parentais e amostras de populações de família de irmãos completos do tipo completamente informativas, e também não completamente informativas. As amostras geradas foram de 100, 200, 400 e 600 indivíduos, com três grupos de ligação cada, e 11 marcas moleculares codominantes e multialélicas, espaçadas a dez centimorgans por grupo de ligação. O tamanho populacional de 200 indivíduos é suficiente para recuperar as informações originais, contudo, para a população não completamente informativa, é necessária a utilização de uma população maior, de 600 indivíduos.

Optimum population size for genetic mapping in full sibling families
Material e Métodos
Resultados e Discussão
Populações não completamente informativas
Número de dados
Média de populações não completamente informativas
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