Abstract
We propose an algorithm for comparing protein-protein complexes based on their functional properties in terms of Gene Ontology. The proposed measure of a functional similarity between complexes is combined with a structural measure to find templates for the template-based docking of protein complexes. We present the results on the modeling of protein complexes based on this algorithm.
Highlights
Знание пространственной организации белковых молекул является ключом не только к пониманию их функций и механизма работы, но и основой для разработки эффективных и безопасных лекарственных средств
A new measure for functional similarity of gene products based on Gene Ontology / A
TM-align: a protein structure alignment algorithm based on the TM-score / Y
Summary
Предлагается алгоритм сравнения белок-белковых комплексов на основе их функциональных свойств в терминах генной онтологии. Мера функциональной схожести комплексов интегрируется со структурной мерой для нахождения шаблона для моделирования белковых комплексов. Приводятся результаты моделирования белковых комплексов с помощью предложенного алгоритма. Ключевые слова: белок-белковые взаимодействия, моделирование белковых комплексов, термины генной онтологии. Для цитирования: Алгоритм предсказания структур белковых комплексов на основе генной онтологии / А. Anishchenko, Petras Kundrotas, Ilya Vakser, Corresponding Member Alexander V.
Sign-in/Register to view highlights & summary Sign-in/Register to access full text options 
Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callMore From: Doklady of the National Academy of Sciences of Belarus
Disclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
