Abstract
INTRODUCCIÓN: Las proteínas son una de las moléculas orgánicas que cumplen funciones vitales en la mantención de la vida y reproducción celular, su fabricación es un proceso complejo gobernado por una secuencia de plegamientos aún desconocida. En el contexto del Covid19, la iniciativa Folding@home llevó a cabo un proyecto de computación distribuida que permite la simulación del proceso de plegamiento de la proteína Spike del Covid19, cuya función es acoplarse al receptor ACE2 de las células animales y así penetrar a la célula y utilizar su maquinaria para reproducirse. OBJETIVO: Probar que el tiempo computacional ocioso disponible en los laboratorios de informática educacionales, puede ser usado para la simulación del plegamiento de proteínas. MÉTODO: Esta fue una investigación descriptiva donde se instaló un software cliente en computadores de gama baja que continuamente enviaron unidades de trabajo de plegamiento proteico a un servidor central. RESULTADOS: Tras 90 días de trabajo, un clúster de 27 PCs finalizaron 1993 unidades de trabajo de simulación de la proteína Spike. DISCUSIÓN Y CONCLUSIONES: A pesar de que el piloteo fue un éxito, se advierte que el software cliente debe ser optimizado para sacar el máximo de provecho a los diferentes procesadores y sistemas operativos con los cuales es compatible el software de computación distribuida proveído por Folding@home.
Highlights
their manufacture is a complex process governed by a sequence of folding
the Folding@home initiative carried out a distributed computing project that allows the simulation of the folding process
whose function is to couple to the ACE2 receptor
Summary
Respecto de las consideraciones éticas, en este estudio no se trabajó con seres humanos, sino con datos simulados en computadoras y dispositivos de propiedad estatal, por tanto, se solicitó a la máxima autoridad de Educación, correspondiente al Director de Administración Educacional Municipal, la autorización para desarrollar este estudio, asimismo, se solicitó autorización de los directores de los respectivos establecimientos. Una vez finalizada la instalación, se procedió a dar ajustes finos a través del software de control (Figura 3), tales ajustes consistieron en establecer el poder de plegamiento (la opción bajo medio y alto están disponibles) y permitir la simulación sólo en ausencia de trabajo por parte de los usuarios, es decir, cuando nadie hiciera uso de los equipos. Este sitio web proveído por Folding@home permitió monitorear los avances de cada equipo día a día en cuanto a su rendimiento individual y colectivo sobre las simulaciones de la proteína Spike. Sitio web proveído por Folding@home para apilamiento de reportes de progreso sobre unidades de trabajo asignadas a cada computador corriendo el software cliente. Cada unidad de trabajo se refiere a los datos enviados por el servidor de Folding@home a un cliente, que fueron modelados en un computador y que han sido satisfactoriamente enviados de vuelta al servidor
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