Abstract
Background. VNTR-polymorphism at 5 HTTLPR regulatory region of human serotonin transporter gene SLC6A4, which is associated with some psychiatric diseases and personality traits, is presented by two alleles, S and L, affecting the gene transcription level. A correlation between the S allele frequency in populations of European and Asian origin and a Hofstede’s individualism-collectivism index was revealed and a hypothesis of culture-gene coevolution was suggested (Chiao, Blizinsky, 2010). Methods. As another reason for the correlation we examined underlying population genetic substructure, which may affect genetic association level. Results. We have experimentally established the 5 HTTLPR genotypes for 2144 individuals to calculate S and L allele frequencies in 21 populations of Eurasia and Africa. In contrast to Eurasia populations, we have found low S allele frequencies in all four African populations studied, although the collectivism index in the populations was high. The total set of Eurasian and African populations analysis does not confirm the correlation (R= 0.263, p=0.146). We have applied principal component (PC) analysis to check a correlation between S allele frequency distribution and a frequency distribution for alleles which are supposed to be neutral. PC analysis for 68 alleles of five CODIS STR loci revealed correlation between PC2 and S allele frequency (R= 0.820, p0.0001). The correlation means that S allele frequency distribution corresponds to general genetic variability distribution in the human populations studied. The correlation between the Hofestede’s index and frequency of four out of 68 STR alleles is even higher than the correlation with S allele frequency in the same populations. Conclusion. Our findings do not support the hypothesis on culture-gene coevolution of “individualism-collectivism” and the S allele frequency of serotonin transporter gene.
Highlights
В исследованиях ассоциации генов с рядом психологических особенностей и психических заболеваний значительное внимание уделяется ген-средовым взаимодействиям
Для 4 из 68 исследованных аллелей уровень корреляции частоты STR аллеля с индексом индивидуализма-коллективизма по Хофстеду даже выше
in the serotonin transporter promoter gene is associated with DSM
Summary
Чао и Близински из-за некорректного формирования исследуемой выборки и отсутствия должного контроля генетической дифференциации популяций сделали заключение о ген-культурной коэволюции частот аллелей гена транспортера серотонина и индивидуа-. Вслед за публикацией (Chiao, Blizinsky, 2009) появились аналогичные исследования, в которых частоты аллелей в популяциях сопоставляются с культурными характеристиками обществ (Way, Lieberman, 2010; Bisso-Machado et al, 2013), при этом справедливые критические замечания (Eisenberg, Hayes, 2011) в отношении исходной статьи авторами более поздних публикаций не учтены. При анализе корреляции частоты аллеля S с главными компонентами, рассчитанными по частотам 68 аллелей 5 STR-локусов системы CODIS показана значимая корреляция с PC2, что указывает на соответствие межпопуляционных различий в частоте аллеля S общей изменчивости генетической структуры популяций. Частоты аллелей CODIS доступны для многих популяций, мало изученных по остальным локусам и могут служить контролем в набирающих популярность кросс-культурных исследованиях, пытающихся оценить влияние генетических особенностей населения на социальные и культурные характеристики обществ
Sign-in/Register to view highlights & summary Talk to us
Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have
Schedule a callDisclaimer: All third-party content on this website/platform is and will remain the property of their respective owners and is provided on "as is" basis without any warranties, express or implied. Use of third-party content does not indicate any affiliation, sponsorship with or endorsement by them. Any references to third-party content is to identify the corresponding services and shall be considered fair use under The CopyrightLaw.
