Sequence analysis of toxin-coregulated pilus gene of Vibrio cholerae strains isolated from China

Abstract

目的 对我国霍乱弧菌(VC)毒力协同调节菌毛(tcpA)基因进行序列分析.方法 38株VC的tcpA基因经聚合酶链反应扩增、测序和序列分析.结果 13株O139群VC产毒株和15株EVC产毒株(均为流行株)的tcpA类型与EVC标准株N16961为同一类型,共有4个位点碱基发生变异,分为5个亚型.EVC流行株中2 株非产毒株的tcpA类型,1株同N16961,1株为新类型.6株EVC非流行株均为非产毒株,分为2种新类型.2株非O1非O139群VC均为非产毒株,为2种新类型.4种新类型与国外4种类型基因和氨基酸序列比较,同源性为63.8%～84.6%和60.6%～91.7%,趋异性为17.8%～44.6%和8.8%～45.8%,tcpA基因所在的VPI毒力岛的结构是完整的,但部分基因存在一定变异.结论 O139群VC产毒株可能起源于EVC产毒株,然后再进一步分化;在非产毒VC中发现4种新类型tcpA基因。