Abstract
Background: Like endemic coronaviruses, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is believed to have emerged in humans from a zoonotic source and may ultimately develop a seasonal pattern. A seasonal pattern, particularly if combined with other seasonal outbreaks of respiratory virus infections, may have significant impacts on the healthcare system. We evaluated the seasonal pattern of existing endemic coronaviruses and several other common respiratory viruses to determine the potential impacts of added burden of respiratory disease should SARS-CoV-2 establish seasonality. Methods: National surveillance data for laboratory confirmations of endemic coronaviruses, influenza A and B viruses, rhinovirus/enterovirus, human metapneumovirus, respiratory syncytial virus and parainfluenza virus for the past 10 years were obtained from the Government of Canada Open Data and FluWatch. Epidemic curves were generated from total case numbers and percent of samples testing positive for each respiratory virus by epidemiological week. Results: In Canada, endemic coronaviruses and other common respiratory viruses cause annual seasonal outbreaks in the winter months. Should SARS-CoV-2 develop a seasonal pattern similar to endemic coronaviruses and respiratory viruses, co-circulation would be expected to peak between January and March. Peak endemic coronavirus activity occurs during the nadir of rhinovirus/enterovirus and parainfluenza activity. Conclusion: Healthcare settings, assisted-living and long-term care homes, schools and essential services employers should anticipate and have contingencies for seasonal outbreaks of SARS-CoV-2 and co-circulating respiratory viruses during peak seasons. Given the likelihood of co-circulation, diagnostic multiplex testing targeting co-circulating pathogens may be more efficient than single target assays for symptomatic individuals if a seasonal pattern to coronavirus disease 2019 (COVID-19) is established.
Highlights
En décembre 2019, un nouveau type de coronavirus, le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS‐CoV‐2), a émergé et s’est répandu rapidement et mondialement grâce à une transmission efficace de personne à personne [1]
Compte tenu de la probabilité de co-circulation, les tests de diagnostic multiplex ciblant les agents pathogènes en co-circulation peuvent être plus efficaces que les essais ciblés pour les personnes symptomatiques si la maladie à coronavirus 2019 (COVID‐19) établissait un profil saisonnier
Bien qu’il ne soit pas certain que le SRAS-CoV-2 établisse un profil saisonnier semblable, le virus est clairement établi dans la population humaine et il faut présumer que la saisonnalité éventuelle est une forte possibilité étant donné le profil saisonnier bien établi dans les coronavirus endémiques couramment en circulation
Summary
En décembre 2019, un nouveau type de coronavirus, le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS‐CoV‐2), a émergé et s’est répandu rapidement et mondialement grâce à une transmission efficace de personne à personne [1]. On croit actuellement que le virus est sorti d’un réservoir zoonotique et qu’il est étroitement lié aux coronavirus connus de chauves‐souris; toutefois, la voie zoonotique exacte d’une transmission efficace de personne à personne demeure inconnue [2]. Malgré l’origine zoonotique commune à tous les coronavirus, seule une partie a établi l’endémicité. Il y a quatre coronavirus endémiques qui circulent chez les humains (bien avant le SRAS‐CoV‐2); chacun d’eux est sorti des réservoirs zoonotiques à des moments différents (tableau 1) [2]. Bien que les facteurs associés à un virus établissant l’endémicité ne soient pas connus, les virus qui établissent l’endémicité ont des caractéristiques communes : une diffusion efficace de personne à personne; une expansion mondiale; et une gravité limitée (les symptômes graves contribuent à un confinement rapide des cas). Tableau 1 : Coronavirus humains endémiques en circulation avant le transfert zoonotique aux humains et le calendrier d’émergence basé sur l’analyse moléculaire
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