Screening and identification of novel drug-resistant genes in CD133+ and CD133- lung adenosarcoma cells using cDNA microarray

Abstract

背景与目的肿瘤干细胞可能是肿瘤多药耐药的主要原因，CD133是目前较为公认的肿瘤干细胞标记物。本研究旨在应用功能分类基因芯片筛选CD133+和CD133-肺腺癌细胞中差异表达的肿瘤耐药基因，寻求新的肺癌耐药相关基因。方法免疫磁珠分选法分选A549细胞，采用功能分类基因芯片筛选CD133+和CD133-肺腺癌细胞中差异表达的肿瘤耐药基因，并使用RT-qPCR验证。顺铂半数有效抑制浓度（half inhibiting concentration, IC50）、阿霉素IC50作用A549细胞48 h后，RT-qPCR检测肿瘤耐药基因CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、GSK3α、PPARα和PPARβ/δ的表达变化。结果共筛查出31个差异表达的肿瘤耐药基因，与CD133-细胞相比，CD133+细胞有30个基因表达上调，1个基因表达下调。RT-qPCR结果与芯片一致。A549细胞经1.97 μg/mL顺铂或0.61 μg/mL阿霉素作用48 h后，CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、GSK3α、PPARα和PPARβ/δ等肿瘤耐药基因表达上调。结论利用功能分类基因芯片筛选出31个可能与CD133+肺腺癌细胞耐药相关的基因，其中CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、GSK3α、PPARα和PPARβ/δ为新发现的肺癌耐药相关基因。