RNA interference in formation of the somatic genome of ciliates Paramecium and Tetrahymena

Irina V Nekrasova,Alexey A Potekhin

doi:10.17816/ecogen1645-22

Abstract

Ciliates are the model of choice to study RNA interference, the mechanism playing key role in biology of these protists. The genome scanning processes of two ciliates, Tetrahymena and Paramecium (Oligohymenophorea), leading to formation of the somatic genome from the chromosomes of the generative nucleus are compared in the review. Matching of several simulta neously present in one cell genomes is mediated by small RNAs and results in precise reproduction of maternal somatic genome in the sexual progeny.

Highlights

CC Инфузории являются отличной моделью для исследования интерференции РНК, играющей важнейшую роль в био логии этих протистов
RNA interference in formation of the somatic genome of ciliates Paramecium and Tetrahymena
CC Ciliates are the model of choice to study RNA interference, the mechanism playing key role in biology of these protists

Summary

ОСОБЕННОСТИ ФОРМИРОВАНИЯ ГЕНОМА МАКРОНУКЛЕУСА У TETRAHYMENA И PARAMECIUM

Процессы формирования генома МАК принципиально различаются у инфузорий разных классов; в этом обзоре мы сфокусируемся на двух модельных представителях класса Oligohymenophorea — Paramecium tetraurelia и Tetrahymena thermophila. Что гены, в кодирующих последовательностях которых располагаются эти IES, экспрессируются на поздних этапах конъюгации, совпадающих со временем удаления IES из генома МАК, и кодируют белки, возможно, участвующие в реорганизации хроматина [13] Являются ли эти совпадения случайными или отражают эволюцию Cbs, пока остается неясным, но предполагают, что сами Cbs и пока неизвестный белок, узнающий Cbs и инициирующий разрыв, могли произойти из мобильного элемента, доместицированного в геноме именно для обеспечения фрагментации хромосом при формировании генома МАК [13]. Что не все последовательности, фланкированные в МИК Cbs и приобретающие теломеры в процессе формирования генома, сохраняются в геноме зрелого МАК. В самом начале полового процесса как у тетрахимен, так и у парамеций происходит двунаправленная транскрипция генома МИК с образованием двуцепочечных РНК (дцРНК). На ранних этапах конъюгации происходит двунаправленная транскрипция генома МИК, затрагивающая как кодирующие последовательности (прямая черная линия), так и A-IES (голубой прямоугольник).

Сканирующие РНК

Обмен пронуклеусами

CC Information about the authors