Abstract

There are natural foci of Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) that vectored by Hyalomma marginatum ticks in Volga river delta (Astrakhan region, South of Russia). The circulation of Dhori virus (DHOV) (Thogotovirus: Orthomyxoviridae) has been also shown here. We hypothesized that other tick-borne arboviruses are also likely to circulate in the region. In particular, Bhanja virus (Phlebovirus: Phenuiviridae), Wad Medani virus (Orbivirus: Reoviridae), and Tamdy virus (Orthonairovirus: Nairoviridae), which were found to circulate in neighboring regions and are vectored by Haemaphysalis spp., Dermacenter spp., and Hyalomma spp. ticks. The aim of the study was to examine ixodid ticks in Volga river delta for the presence of CCHFV, DHOV, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus. Ticks were collected in Volga river delta in 2017. We used molecular genetic methods for the detection and analysis of nucleic acids (PCR, sequencing, phylogenetic analysis). We detect CCHFV and DHOV RNA in H. marginatum ticks. The rate of infected H. marginatum ticks was 1.98% for CCHFV and 0.4% for DHOV. The results of genetic analysis showed that found DHOV strains are almost identical (99-100% in the M gene) and forms a separate genetic lineage alongside of Batken virus from Central Asia. At the same time, Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus were not found in ticks, collected in this region. DHOV is circulating in the natural foci of CCHF in the Volga river delta. The ratio of infection of H. marginatum with CCHFV and DHOV was determined for the first time.

Highlights

  • There are natural foci of Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) that vectored by Hyalomma marginatum ticks in Volga river delta (Astrakhan region, South of Russia)

  • Bhanja virus (Phlebovirus: Phenuiviridae), Wad Medani virus (Orbivirus: Reoviridae), and Tamdy virus (Orthonairovirus: Nairoviridae), which were found to circulate in neighboring regions and are vectored by Haemaphysalis spp., Dermacenter spp., and Hyalomma spp. ticks

  • Bhanja virus, Wad Medani virus, and Tamdy virus were not found in ticks, collected in this region

Read more

Summary

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Вакалова Е.В.1,4,5, Бутенко А.М.2, Вишневская Т.В.2, Дорофеева Т.Е.2, Гительман А.К.2, Куликова Л.Н.3, Львов Д.К. 2, Альховский С.В.2. Результаты обследования клещей в дельте Волги (Астраханская область, 2017 год) на вирус Крымской-Конго геморрагической лихорадки (Nairoviridae, Orthonairovirus, CCHFV) и другие клещевые арбовирусы. В дельте Волги (Астраханская область) расположены активные природные очаги Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ), основным переносчиком которой служат клещи Hyalomma marginatum. И Dermacenter spp., таких как вирусы Бханджа (Phlebovirus: Phenuiviridae), Вад Медани (Orbivirus: Reoviridae) и Тамды (Orthonairovirus: Nairoviridae). Цель работы – исследование иксодовых клещей, распространённых в дельте Волги, на наличие клещевых арбовирусов, включая вирус ККГЛ и малоизученные вирусы Дхори, Бханджа, Вад Медани, и Тамды. Заражённость клещей H. marginatum вирусами ККГЛ и Дхори в дельте Волги составила 1,98 и 0,4% соответственно. Результаты генетического анализа показали, что циркулирующая здесь популяция вируса Дхори гомогенна (99–100% по гену М) и формирует отдельный генетический кластер, для которого вирус Баткен (антигенный вариант вируса Дхори) из Средней Азии является ближайшей внешней группой. Ключевые слова: клещевые арбовирусы; Крымская-Конго геморрагическая лихорадка; вирус Дхори; Hyalomma marginatum; Dermacenter marginatus

Оригинальные исследования
Introduction
Материал и методы
раунд ПЦР ОТ и I раунд ПЦР
Full Text
Published version (Free)

Talk to us

Join us for a 30 min session where you can share your feedback and ask us any queries you have

Schedule a call