RAPD마크를 이용한 한국 내 괭이밥속 식물의 유전적 다양성과 표현형 관계

Abstract

RAPD마크를 이용한 한국 내 괭이밥속(Oxalis L.) 식물의 유전적 다양성과 표현형 관계를 평가하였다. 10개의 시발체로 125개의 밴드를 얻었으며 시발체당 12.5개였다. 이들 밴드 중 121개(96.8%)는 다형성을 나타내었으며 단지 4개만 단형성을 나타내었다. 6개 분류군에서 RAPD 표현형의 평균은 3.6개(선괭이밥, 괭이밥)에서 4.8개(붉은괭이밥)였다. 종간 변이에서 선괭이밥과 자주괭이밥이 가장 낮은 변이를 나타내었으며(28.8%), 붉은괭이밥이 가장 높은 변이를 나타내었다(38.4%). 분류군 내 대립유전자좌위는 평균 32.7%였다. 종 간 전체 유전적 다양도와 종내 유전적 다양도는 각각 0.362와 0.122였다. 종간 분화에 근거한 전체 변이의 몫(<TEX>$G_{ST}$</TEX>)은 0.663이였다. 이는 전체 변이의 66.3%는 종간에 있음을 나타낸다. NJ tree에서 선괭이밥과 붉은괭이밥의 분지군은 높은 지지도를 가지며 괭이밥과 자매군을 형성하였다. 염색체의 수와 RAPD의 표현형적 관계와 일치하지 않았다. We evaluated the phenetic relationships within six taxa of genus Oxalis L. in Korea with random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Ten primers produced 125 bands for six taxa, and the mean number of bands per primer was 12.5. Across the six taxa, 121 (96.8%) bands were polymorphic, and only four were monomorphic. The mean number of RAPD phenotypes across the six taxa varied from 3.6 (O. stricta and O. corymbosa) to 4.8 (O. corniculata for. rubrifolia). In a simple measure of intraspecies variability according to the percentage of polymorphic bands, O. stricta and O. corymbosa exhibited the lowest variation (28.8%), and O. corniculata for. rubrifolia showed the highest (38.4%). A mean of 32.7% of the loci was polymorphic within taxa. The total interspecies genetic diversity (<TEX>$H_T$</TEX>) and intraspecies genetic diversity (<TEX>$H_S$</TEX>) was 0.362 and 0.122, respectively. On a per-locus basis, the proportion of total genetic variation due to differences among species (<TEX>$G_{ST}$</TEX>) was 0.663. This indicates that about 66.3% of the total variation was among species. The node of O. stricta and O. corniculata for. rubrifolia was strongly supported, with a high bootstrap value in the NJ tree and sistered with O. corniculata. According to RAPD analysis, the number of chromosomes was not congruent with a phenetic relationship.