Preliminary NMR investigation of Tat alternative splicing regulation in HIV-1

Abstract

Splicing of the HIV-1 primary transcript is highly regulated. Maintenance of proper equilibrium among spliced, unspliced and partially spliced transcripts is essential for replication of the virus. Interaction between an RNA sequence within tat exon 2, called the proximal exonic splicing silencer two (pESS2), and its binding protein, the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H (hnRNP H), is crucial for the splicing regulation of the upstream intron. A preliminary structural study of the two biomolecules forming the complex is presented. The biomolecules design strategy chosen to make the analysis feasible by NMR and their production is presented. The first NMR data establishing the RNA secondary structure is shown, along with the preliminary NMR results obtained with the protein constructs. They found the feasibility of the structural project. To cite this article: S. Cabal, É. Guittet, C. R. Chimie 9 (2006). L'épissage des transcrits primaires du VIH-1 est hautement régulé. Le maintien du bon équilibre entre les transcrits épissés, non épissés ou partiellement épissés est essentiel pour la réplication du virus. Les interactions entre une séquence ARN de l'exon 2 de Tat, la séquence exonique proximale inhibitrice d'épissage 2 (pESS2), et sa protéine de liaison, la particule ribonucléique nucléaire hétérogène (hnRNP H) sont cruciales pour la régulation. Nous présentons une étude structurale préliminaire des deux macromolécules formant le complexe. La stratégie de dessin des biomolécules choisies pour réaliser une étude RMN est décrite ainsi que leur production. Les premières données établissant la structure secondaire de l'ARN sélectionné seront présentées, ainsi que les résultats préliminaires sur les construits protéiques. Ils fondent la faisabilité de l'étude structurale entreprise. Pour citer cet article : S. Cabal, É. Guittet, C. R. Chimie 9 (2006).